150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5267 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 118 aa  239  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1094  FmdB transcriptional regulator  46.39 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176161  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  45.16 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  45.9 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  47.27 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1970  regulatory protein, FmdB family  51.79 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  50.85 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  50.85 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  37.08 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000617496  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  53.57 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  49.21 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  46.15 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  48.21 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  51.61 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  51.79 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  46.43 
 
 		 90 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  54.24 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  35.96 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  37.14 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0924  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16440  putative regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324116  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  45.45 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11009  serine rich protein  46.43 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.667745 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  45.57 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  45.61 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  40.22 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0834  regulatory protein, FmdB family  51.79 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  46.43 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  46.43 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2815  regulatory protein, FmdB family  48.21 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.640652  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0875  regulatory protein, FmdB family  44.83 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  46.43 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0213  FmdB family regulatory protein  35.92 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  46.03 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  44.64 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  44.64 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1295  hypothetical protein  48.28 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0801  regulatory protein, FmdB family  48.28 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  42.11 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1895  FmdB family regulatory protein  46.43 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.448819  normal  0.145207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  44.64 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0195  regulatory protein, FmdB family  50.85 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  47.62 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  41.33 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4835  FmdB family regulatory protein  46.43 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30590  putative regulatory protein, FmdB family  48.21 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0140948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  42.11 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0371  hypothetical protein  46.43 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0206  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000235601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1830  regulatory protein, FmdB family  41.56 
 
 		 83 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0872  FmdB family regulatory protein  48.28 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0626  regulatory protein, FmdB family  48.21 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  44.83 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  31.71 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0104  hypothetical protein  43.06 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6324  regulatory protein, FmdB family  37.04 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  46.55 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  38.03 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  48.39 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  42.86 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  38.33 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  48.21 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  48.28 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  38.33 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  39.68 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0908  regulatory protein, FmdB family  45.45 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  41.67 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32690  putative regulatory protein, FmdB family  45.45 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.914233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  40.98 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  40.98 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  45.76 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  46.03 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  44.12 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  44.64 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  44.64 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  44.12 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  39.47 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  32.35 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  32.35 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  44.83 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4670  FmdB family regulatory protein  44.64 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0329006  normal  0.590525 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  44.83 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23900  putative regulatory protein, FmdB family  44.64 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  44.83 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  44.83 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  44.83 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  44.83 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  44.83 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  37.11 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>