153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1094 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1094  FmdB transcriptional regulator  100 
 
 		 89 aa  184  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  46.39 
 
 		 118 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0213  FmdB family regulatory protein  44.94 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119501 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  49.21 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0924  regulatory protein, FmdB family  43.82 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  44.71 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  44.71 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  39.29 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  50.79 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  44 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  42.53 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  46.03 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  44 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  38.37 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  38.37 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  43.75 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0875  regulatory protein, FmdB family  48.28 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  40.23 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145953  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  50.88 
 
 		 82 aa  62  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  43.55 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1114  regulatory protein, FmdB family  50.88 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00330778  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  34.88 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000617496  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  43.75 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  43.75 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  43.75 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  43.75 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0206  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000235601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  44.44 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  45.78 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2815  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.640652  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0801  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  42.22 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  40.51 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16440  putative regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0872  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0781  FmdB family regulatory protein  43.06 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000492398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0804  FmdB family regulatory protein  43.06 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000263979  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30590  putative regulatory protein, FmdB family  48.21 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0140948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  46.43 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  43.75 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  45 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  48.39 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  39.71 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  44.78 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  44.78 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  42.86 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  40.26 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  46.67 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  46.03 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  45.45 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1830  regulatory protein, FmdB family  43.66 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  46.43 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  41.54 
 
 		 93 aa  57  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0572  FmdB family regulatory protein  46.77 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  46.77 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  39.13 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  39.13 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  46.77 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  46.77 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  41.89 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  46.77 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  36.99 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  46.03 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  40.68 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1970  regulatory protein, FmdB family  46.43 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  46.43 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  46.43 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0708  FmdB family regulatory protein  41.07 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.001557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  45.16 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11009  serine rich protein  39.29 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.667745 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  45.16 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  40.66 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0371  hypothetical protein  48.21 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4588  regulatory protein, FmdB family  38.98 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.691856  normal  0.396421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3639  FmdB family regulatory protein  46.55 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  35.62 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  43.08 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  41.07 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  35.06 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  35.44 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  35.62 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  35.62 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1295  hypothetical protein  44.26 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  38.98 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  35.62 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32690  putative regulatory protein, FmdB family  47.27 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.914233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2465  regulatory protein, FmdB family  37.14 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0532528  hitchhiker  0.00128388 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  44.26 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  44.26 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>