157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4089 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 120 aa  230  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0371  hypothetical protein  85.96 
 
 		 95 aa  114  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  64.94 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  69.35 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  78.95 
 
 		 93 aa  104  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  78.57 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  64.29 
 
 		 119 aa  103  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0626  regulatory protein, FmdB family  78.95 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4835  FmdB family regulatory protein  66.15 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  70.77 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  67.19 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  67.19 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30590  putative regulatory protein, FmdB family  73.68 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0140948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  76.79 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  51.02 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  60.24 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4670  FmdB family regulatory protein  66.67 
 
 		 113 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0329006  normal  0.590525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1411  regulatory protein, FmdB family  71.93 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  61.97 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0834  regulatory protein, FmdB family  75.44 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1895  FmdB family regulatory protein  70.18 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.448819  normal  0.145207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  66.15 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  75 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0908  regulatory protein, FmdB family  72.73 
 
 		 96 aa  97.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11009  serine rich protein  62.5 
 
 		 110 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.667745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  64.62 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32690  putative regulatory protein, FmdB family  74.55 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.914233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6324  regulatory protein, FmdB family  45.69 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2815  regulatory protein, FmdB family  70.18 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.640652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3191  FmdB family regulatory protein  71.7 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  73.21 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23900  putative regulatory protein, FmdB family  66.67 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  47.41 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16440  putative regulatory protein, FmdB family  66.67 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324116  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1970  regulatory protein, FmdB family  64.29 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  58.93 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0875  regulatory protein, FmdB family  65.52 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3034  FmdB family regulatory protein  59.7 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  55.41 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  62.3 
 
 		 61 aa  80.1  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1727  regulatory protein, FmdB family  57.14 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0359754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1830  regulatory protein, FmdB family  51.56 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2140  FmdB family regulatory protein  62.3 
 
 		 99 aa  76.6  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 71 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  62.07 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0232  regulatory protein, FmdB family  57.89 
 
 		 58 aa  74.7  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  55 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0781  FmdB family regulatory protein  43.42 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000492398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0804  FmdB family regulatory protein  43.42 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000263979  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  60.34 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  60.34 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  39.81 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  53.45 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  50.79 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  44.57 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000617496  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  37.5 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  38.55 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  46.15 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  37.76 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  34.95 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  54.55 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  45.57 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1114  regulatory protein, FmdB family  48.21 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00330778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  47.69 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0195  regulatory protein, FmdB family  50.82 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  46.15 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  47.17 
 
 		 83 aa  62  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  42.5 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  43.75 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0277  FmdB family regulatory protein  45.59 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000770488  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1094  FmdB transcriptional regulator  37.23 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  38.24 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  44.62 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  49.12 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  49.12 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  40.48 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  44.62 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  39.78 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  41.1 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  44.62 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0104  hypothetical protein  49.12 
 
 		 69 aa  60.1  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  38.46 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  44.64 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145953  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  38.46 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  44.3 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  45.61 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  42.53 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  49.12 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  48.28 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  38.82 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0029  FmdB family regulatory protein  44.26 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2782  FmdB family regulatory protein  47.37 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155022  normal  0.0575706 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  49.12 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  49.12 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  47.37 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  49.12 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  37.8 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  37.8 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  47.37 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>