152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11009 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11009  serine rich protein  100 
 
 		 110 aa  214  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.667745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  77.14 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  77.14 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4670  FmdB family regulatory protein  82.26 
 
 		 113 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0329006  normal  0.590525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4835  FmdB family regulatory protein  78.12 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1895  FmdB family regulatory protein  77.42 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.448819  normal  0.145207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1411  regulatory protein, FmdB family  71.19 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  58.33 
 
 		 120 aa  103  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  55.56 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  72.41 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  67.24 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  74.14 
 
 		 93 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  61.76 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0626  regulatory protein, FmdB family  70.69 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  69.64 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  65 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0834  regulatory protein, FmdB family  68.97 
 
 		 117 aa  94.4  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23900  putative regulatory protein, FmdB family  70.69 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  53.52 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  63.33 
 
 		 81 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0371  hypothetical protein  63.16 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  47.37 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  66.07 
 
 		 118 aa  90.5  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30590  putative regulatory protein, FmdB family  64.91 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0140948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16440  putative regulatory protein, FmdB family  68.97 
 
 		 92 aa  90.1  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324116  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  67.86 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  62.07 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  66.07 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2815  regulatory protein, FmdB family  60.34 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.640652  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6324  regulatory protein, FmdB family  45.37 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0908  regulatory protein, FmdB family  63.64 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  47.22 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32690  putative regulatory protein, FmdB family  60 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.914233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3191  FmdB family regulatory protein  62.26 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1970  regulatory protein, FmdB family  57.14 
 
 		 67 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  48.61 
 
 		 71 aa  77  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0875  regulatory protein, FmdB family  53.45 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1830  regulatory protein, FmdB family  45 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  46.43 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3034  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1114  regulatory protein, FmdB family  46.43 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00330778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  39.36 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  31.78 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  41.24 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  50.79 
 
 		 61 aa  67.4  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  35.87 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1727  regulatory protein, FmdB family  48.33 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0359754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2140  FmdB family regulatory protein  49.18 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  35.87 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  36.73 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  39.36 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000617496  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0781  FmdB family regulatory protein  37.88 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000492398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0804  FmdB family regulatory protein  37.88 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000263979  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  38.36 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  38.36 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  32.97 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0232  regulatory protein, FmdB family  47.37 
 
 		 58 aa  62.8  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  36.76 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  38.82 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145953  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  46.67 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0029  FmdB family regulatory protein  38.81 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  37.97 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  35.96 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  48.28 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0277  FmdB family regulatory protein  37.33 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000770488  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1094  FmdB transcriptional regulator  39.29 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176161  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  36.14 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  35.38 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  33.75 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  36.59 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  41.94 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  41.54 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  33.82 
 
 		 91 aa  57  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  33.82 
 
 		 91 aa  57  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  36 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  46.55 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  35.29 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0213  FmdB family regulatory protein  39.47 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  41.38 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  36.51 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  37.04 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0206  hypothetical protein  37.04 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000235601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  36.36 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4588  regulatory protein, FmdB family  38.89 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.691856  normal  0.396421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  37.04 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  34.78 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  36.92 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2782  FmdB family regulatory protein  41.27 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155022  normal  0.0575706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  40.68 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  34.15 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  40.54 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  34.25 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  34.15 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  34.15 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  34.15 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>