129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0277 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0277  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 69 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000770488  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0029  FmdB family regulatory protein  67.19 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204115  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0781  FmdB family regulatory protein  55.88 
 
 		 75 aa  90.5  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000492398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0804  FmdB family regulatory protein  55.88 
 
 		 75 aa  90.5  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000263979  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0708  FmdB family regulatory protein  64.29 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.001557  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  43.08 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  44.12 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  40.91 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  40.91 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6324  regulatory protein, FmdB family  48.33 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  45.59 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  44.83 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4670  FmdB family regulatory protein  42.37 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0329006  normal  0.590525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  40.62 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  43.1 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  43.1 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  43.1 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  37.68 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4835  FmdB family regulatory protein  42.37 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0626  regulatory protein, FmdB family  44.83 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1895  FmdB family regulatory protein  42.37 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.448819  normal  0.145207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  46.43 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0371  hypothetical protein  46.43 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  44.83 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  46.43 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11009  serine rich protein  39.13 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.667745 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16440  putative regulatory protein, FmdB family  44.83 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  45.76 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  40.62 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  44.83 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2815  regulatory protein, FmdB family  43.1 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.640652  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3034  FmdB family regulatory protein  42.03 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1411  regulatory protein, FmdB family  42.37 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1727  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0359754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  35.71 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30590  putative regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0140948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2140  FmdB family regulatory protein  44.26 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32690  putative regulatory protein, FmdB family  41.82 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.914233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3191  FmdB family regulatory protein  45.28 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  36.23 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0875  regulatory protein, FmdB family  44.83 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  38.03 
 
 		 89 aa  50.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  45.61 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  39.66 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  37.84 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  39.29 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145953  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4588  regulatory protein, FmdB family  41.51 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.691856  normal  0.396421 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1114  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00330778  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1830  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 83 aa  48.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  36.84 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  40.62 
 
 		 101 aa  47.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  38.57 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  40.68 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23900  putative regulatory protein, FmdB family  37.93 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0213  FmdB family regulatory protein  44.64 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119501 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0834  regulatory protein, FmdB family  37.93 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  41.07 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3639  FmdB family regulatory protein  38.6 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  41.07 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0232  regulatory protein, FmdB family  42.11 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  41.07 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  41.07 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  36.84 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  38.6 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  38.6 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  38.6 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0908  regulatory protein, FmdB family  38.18 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  38.6 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1970  regulatory protein, FmdB family  41.07 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  35.59 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  38.98 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0924  regulatory protein, FmdB family  36.62 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  36.84 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0440  hypothetical protein  31.08 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  31.88 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  36.84 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1295  hypothetical protein  37.29 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  31.88 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  31.88 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  31.88 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  31.88 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  31.88 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  37.29 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  36.84 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  36.84 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  36.84 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0195  regulatory protein, FmdB family  40.98 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  37.29 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  37.29 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  36.84 
 
 		 115 aa  43.9  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  36.67 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0572  FmdB family regulatory protein  36.84 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  36.84 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2923  regulatory protein, FmdB family  36.21 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  36.84 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  36.84 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>