150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1673 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  130  6e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0232  regulatory protein, FmdB family  75.86 
 
 		 58 aa  99.8  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0371  hypothetical protein  66.67 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  62.3 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  57.89 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  61.4 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  57.89 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0834  regulatory protein, FmdB family  59.65 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  61.4 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2815  regulatory protein, FmdB family  55 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.640652  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  56.45 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  50.85 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  55.17 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  54.39 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  52.63 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16440  putative regulatory protein, FmdB family  56.14 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324116  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30590  putative regulatory protein, FmdB family  55.17 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0140948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  54.39 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  52.63 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0626  regulatory protein, FmdB family  53.33 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  56.14 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  50.88 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  52.63 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  47.54 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6324  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11009  serine rich protein  50.79 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.667745 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1970  regulatory protein, FmdB family  52.63 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23900  putative regulatory protein, FmdB family  52.63 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  50.88 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  50.88 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4670  FmdB family regulatory protein  50.88 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0329006  normal  0.590525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  50.88 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  46.55 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4835  FmdB family regulatory protein  50.79 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0908  regulatory protein, FmdB family  53.57 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  44.07 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32690  putative regulatory protein, FmdB family  53.57 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.914233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  48.28 
 
 		 81 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1411  regulatory protein, FmdB family  50.88 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3191  FmdB family regulatory protein  53.7 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1895  FmdB family regulatory protein  49.12 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.448819  normal  0.145207 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  43.55 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  49.21 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  45.61 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  49.18 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1830  regulatory protein, FmdB family  50.88 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  49.12 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0875  regulatory protein, FmdB family  52.54 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  40.35 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1727  regulatory protein, FmdB family  52.46 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0359754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  44.26 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0801  regulatory protein, FmdB family  42.62 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0872  FmdB family regulatory protein  42.62 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3034  FmdB family regulatory protein  51.72 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2140  FmdB family regulatory protein  51.72 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0708  FmdB family regulatory protein  47.37 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.001557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  42.11 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  41.67 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  42.11 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  41.94 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  42.62 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  42.11 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  42.11 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  42.11 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  42.11 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  42.11 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  41.67 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0195  regulatory protein, FmdB family  48.28 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  40.35 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  49.18 
 
 		 71 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  40.35 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  38.6 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  41.67 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  40.35 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  45.61 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3639  FmdB family regulatory protein  42.11 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  38.6 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0572  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0440  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  48.28 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  42.11 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2782  FmdB family regulatory protein  40.35 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155022  normal  0.0575706 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  41.38 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  40.32 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  42.11 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  42.11 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  40.35 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  38.6 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  40.35 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  40.35 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>