20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2540 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2540  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 70 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2210  hypothetical protein  69.64 
 
 		 81 aa  86.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1341  regulatory protein, FmdB family  71.15 
 
 		 73 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141907  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3419  regulatory protein, FmdB family  74.07 
 
 		 77 aa  84  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0433  FmdB family regulatory protein  68 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.186737  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0648  regulatory protein, FmdB family  72.34 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29350  putative regulatory protein, FmdB family  64.71 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6110  regulatory protein, FmdB family  55.56 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0337  hypothetical protein  46.94 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0363  FmdB family regulatory protein  66.67 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2441  FmdB transcriptional regulator  47.83 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1721  hypothetical protein  40.43 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.468781  normal  0.898434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  42.42 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0865  regulatory protein, FmdB family  36.07 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000475517  normal  0.391737 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  45.45 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  42.55 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_002936  DET0734  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000750313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0637  regulatory protein, FmdB family  38.57 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_640  hypothetical protein  40.48 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000170615  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0665  FmdB family regulatory protein  38.1 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000563996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>