41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1512 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  190  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2195  FmdB family regulatory protein  32.5 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0594  FmdB family regulatory protein  42.11 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  43.14 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  46.67 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  47.62 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  39.66 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  51.16 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  42.22 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  42.22 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  51.22 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  40.91 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  46.55 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  51.11 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  45.45 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  47.62 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  43.48 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  46.34 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  38.46 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  43.9 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1403  regulatory protein, FmdB family  53.49 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  41.18 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  38.64 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  40.48 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  37.04 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  41.46 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2457  FmdB family regulatory protein  40.48 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  40.91 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  34.55 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  43.18 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  38.71 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  36.54 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  31.87 
 
 		 80 aa  41.2  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  40.91 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  29.35 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  28.26 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  36.36 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  41.86 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  40 
 
 		 66 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>