20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1341 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1341  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 73 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141907  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0433  FmdB family regulatory protein  76 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.186737  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3419  regulatory protein, FmdB family  68.52 
 
 		 77 aa  80.1  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2540  FmdB family regulatory protein  73.91 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2210  hypothetical protein  68.75 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0648  regulatory protein, FmdB family  71.74 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29350  putative regulatory protein, FmdB family  66.67 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6110  regulatory protein, FmdB family  78.57 
 
 		 69 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0363  FmdB family regulatory protein  75 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0337  hypothetical protein  45 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1721  hypothetical protein  40.43 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.468781  normal  0.898434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2457  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  38.46 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0865  regulatory protein, FmdB family  42 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000475517  normal  0.391737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0363  regulatory protein, FmdB family  35.71 
 
 		 71 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.232661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  37.04 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1599  regulatory protein, FmdB family  31.58 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2441  FmdB transcriptional regulator  39.58 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  34.18 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  40.43 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>