113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2457 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2457  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 77 aa  157  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  41.3 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  47.83 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  47.83 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  46.03 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  34.57 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  47.83 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  35.8 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  41.3 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  35.71 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  45.65 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  43.48 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  35 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  34.52 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  36.96 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  36.96 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  37.31 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2720  regulatory protein, FmdB family  36.14 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  41.3 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  39.13 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1941  FmdB family regulatory protein  34.33 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0534197  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0708  FmdB family regulatory protein  45.65 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.001557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  31.94 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1496  regulatory protein, FmdB family  45.65 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  42.55 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  36.07 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  41.3 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  41.3 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  44.68 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  39.13 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  33.78 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  41.38 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  36.14 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  36.96 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2923  regulatory protein, FmdB family  37.78 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  36.36 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1341  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141907  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  31.25 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0363  regulatory protein, FmdB family  34.33 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.232661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  34.78 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  39.02 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  41.3 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  41.3 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4588  regulatory protein, FmdB family  32.26 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.691856  normal  0.396421 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0637  regulatory protein, FmdB family  27.94 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0834  regulatory protein, FmdB family  40.43 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  34.78 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1295  hypothetical protein  41.3 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  34.57 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  34.78 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  34.78 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  34.78 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  34.78 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  34.78 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  34.78 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  37.18 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  40.43 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  40.43 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  34.78 
 
 		 117 aa  43.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  34.78 
 
 		 117 aa  43.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  34.78 
 
 		 117 aa  43.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  32.18 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  39.13 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  39.13 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  34.78 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0908  regulatory protein, FmdB family  40.43 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  37.93 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1970  regulatory protein, FmdB family  40.43 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  34.78 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  36.17 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  34.78 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  36.96 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  38.46 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  38.3 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0437  hypothetical protein  40.43 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  36.67 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3639  FmdB family regulatory protein  39.13 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0872  FmdB family regulatory protein  39.13 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  30.43 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  40.82 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0572  FmdB family regulatory protein  34.78 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  30.43 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  38.3 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  38.3 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0801  regulatory protein, FmdB family  39.13 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33380  hypothetical protein  34.15 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  34.67 
 
 		 83 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  30.43 
 
 		 85 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  32.61 
 
 		 111 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  45.24 
 
 		 83 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30590  putative regulatory protein, FmdB family  36.17 
 
 		 137 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0140948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  32.61 
 
 		 111 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  36.36 
 
 		 89 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0195  regulatory protein, FmdB family  30.38 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  36.17 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  38.3 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  36.96 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>