153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0708 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0708  FmdB family regulatory protein  100 
 
 
100 aa  201  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.001557  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0781  FmdB family regulatory protein  58.33 
 
 
75 aa  97.8  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000492398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0804  FmdB family regulatory protein  58.33 
 
 
75 aa  97.8  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000263979  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0277  FmdB family regulatory protein  58.82 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000770488  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0029  FmdB family regulatory protein  48.48 
 
 
67 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204115  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  41.1 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  45.31 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  47.76 
 
 
71 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  43.24 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16440  putative regulatory protein, FmdB family  44.83 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324116  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  36.23 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11009  serine rich protein  39.13 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.667745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  34.72 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  37.31 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  39.34 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  36.99 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  36.99 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  36.99 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  36.99 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  42.42 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  36.99 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  36.99 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  35.62 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  37.1 
 
 
128 aa  59.3  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  47.37 
 
 
61 aa  59.7  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  39.66 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1094  FmdB transcriptional regulator  34.62 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176161  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4835  FmdB family regulatory protein  38.33 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  34.29 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  40.91 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  33.82 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  30.67 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  40.26 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0626  regulatory protein, FmdB family  41.38 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  36.36 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  36.36 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2815  regulatory protein, FmdB family  43.1 
 
 
86 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.640652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  36.71 
 
 
101 aa  57.4  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  31.94 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0875  regulatory protein, FmdB family  41.38 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1895  FmdB family regulatory protein  38.33 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.448819  normal  0.145207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4670  FmdB family regulatory protein  38.33 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0329006  normal  0.590525 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  40.35 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  37.88 
 
 
112 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1727  regulatory protein, FmdB family  38.16 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0359754  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4588  regulatory protein, FmdB family  43.4 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.691856  normal  0.396421 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  35.53 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  32.39 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  32.86 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  32.86 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  40.68 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1411  regulatory protein, FmdB family  38.46 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  32.86 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0371  hypothetical protein  40.35 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3034  FmdB family regulatory protein  43.94 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773747  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0232  regulatory protein, FmdB family  43.86 
 
 
58 aa  55.5  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  38.46 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  44.26 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  37.29 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  41.07 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  37.29 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  28.57 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0572  FmdB family regulatory protein  37.29 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13841  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  28.57 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  34.33 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  34.33 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  37.29 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  30.67 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  30.67 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0206  hypothetical protein  31.03 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000235601  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 
118 aa  53.9  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  36.84 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  39.29 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  30.23 
 
 
92 aa  53.5  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 
91 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 
91 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0924  regulatory protein, FmdB family  38.1 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  42.86 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6324  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165247  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  35.29 
 
 
82 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  30.77 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145953  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23900  putative regulatory protein, FmdB family  39.66 
 
 
90 aa  52.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  39.44 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3639  FmdB family regulatory protein  35.59 
 
 
105 aa  52  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2140  FmdB family regulatory protein  42.62 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32690  putative regulatory protein, FmdB family  38.18 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.914233  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30590  putative regulatory protein, FmdB family  40.35 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0140948  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1970  regulatory protein, FmdB family  39.29 
 
 
67 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  36 
 
 
85 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  32.43 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0437  hypothetical protein  35 
 
 
157 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  32.08 
 
 
73 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0834  regulatory protein, FmdB family  34.48 
 
 
117 aa  50.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166433  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  36 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  35.71 
 
 
111 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1114  regulatory protein, FmdB family  39.29 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00330778  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  31.34 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>