149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2923 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2923  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 108 aa  208  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  61.67 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  52.38 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  55.17 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  48 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  42.53 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  46.75 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1727  regulatory protein, FmdB family  51.67 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0359754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  49.15 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  41.56 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  49.3 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  40.45 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3034  FmdB family regulatory protein  51.67 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  50.85 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  47.22 
 
 		 71 aa  67  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  52.46 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  37.21 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  37.21 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  41.18 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2140  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  43.06 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  49.15 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0626  regulatory protein, FmdB family  53.33 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  43.94 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0195  regulatory protein, FmdB family  47.46 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  45.9 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  37.93 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  40.28 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  40.28 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  40.28 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  45.59 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  47.54 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  47.54 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6324  regulatory protein, FmdB family  41.38 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0908  regulatory protein, FmdB family  50.88 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  43.33 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  44.26 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  38.46 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  47.46 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3191  FmdB family regulatory protein  52.73 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  44.12 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0206  hypothetical protein  39.51 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000235601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  35.23 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  35.23 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  35.23 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  35.23 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  33.67 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  33.67 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  34.52 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  46.55 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  38.27 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2782  FmdB family regulatory protein  45 
 
 		 63 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155022  normal  0.0575706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  44.83 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  37.11 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  37.08 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0371  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  41.94 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  41.67 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  41.67 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0834  regulatory protein, FmdB family  46.67 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1411  regulatory protein, FmdB family  43.33 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  43.33 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  35.87 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0875  regulatory protein, FmdB family  45 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  45 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0572  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  39.81 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  37.5 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  44.83 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32690  putative regulatory protein, FmdB family  45.61 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.914233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  41.67 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1895  FmdB family regulatory protein  41.27 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.448819  normal  0.145207 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1830  regulatory protein, FmdB family  43.33 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  41.67 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4835  FmdB family regulatory protein  39.68 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  34 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  41.67 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  43.33 
 
 		 86 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0781  FmdB family regulatory protein  40.85 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000492398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0804  FmdB family regulatory protein  40.85 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000263979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  38.33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  38.33 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  37.7 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4670  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0329006  normal  0.590525 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  44.29 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  44.83 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0924  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3639  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  43.33 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>