24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1941 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1941  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 82 aa  169  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0534197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0363  regulatory protein, FmdB family  73.24 
 
 		 71 aa  116  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.232661  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2603  regulatory protein, FmdB family  61.36 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0829  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000274329  normal  0.31982 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2457  FmdB family regulatory protein  37.74 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1074  regulatory protein, FmdB family  45.65 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  35.71 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  46.67 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  44.9 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2262  hypothetical protein  36.21 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.545917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2544  FmdB family regulatory protein  44.68 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  30.91 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  35.42 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  42.22 
 
 		 81 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  33.82 
 
 		 70 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1567  FmdB family regulatory protein  35.42 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1633  FmdB family regulatory protein  35.42 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  44.44 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  36.73 
 
 		 75 aa  41.2  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  36.36 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  38.78 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  38.78 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2257  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>