59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2544 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2544  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 85 aa  174  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  42.68 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  41.18 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2195  FmdB family regulatory protein  41.18 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  41.46 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  31.58 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  37.31 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  39.62 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  41.51 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  47.73 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  33.96 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0440  hypothetical protein  30.59 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  41.07 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1941  FmdB family regulatory protein  44.68 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0534197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  30.56 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4588  regulatory protein, FmdB family  38.71 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.691856  normal  0.396421 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  29.87 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  30.19 
 
 		 114 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  34.52 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  29.21 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0195  regulatory protein, FmdB family  43.18 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  32.08 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  32.08 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  35.85 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  32.08 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  32.08 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  32.08 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  32.08 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  39.29 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  32.08 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  39.29 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  33.96 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 65 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  32.08 
 
 		 113 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  37.74 
 
 		 88 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145953  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  32.08 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  39.62 
 
 		 113 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  32.08 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  32.08 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  32.08 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  32.08 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  32.08 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  32.08 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  41.51 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  32.08 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  35.06 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  45.45 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0363  regulatory protein, FmdB family  40.43 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.232661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0572  FmdB family regulatory protein  32.08 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1114  regulatory protein, FmdB family  45.28 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00330778  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  30.19 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  30.19 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  30.19 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  33.8 
 
 		 66 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  41.07 
 
 		 73 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  26.92 
 
 		 84 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  38.64 
 
 		 81 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  33.8 
 
 		 66 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>