45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0687 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 80 aa  158  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  46.84 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  53.12 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  40.74 
 
 		 80 aa  60.1  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  53.7 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  60.98 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  58.54 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  55.81 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  42.31 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  36.21 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  42.31 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  39.51 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  40.35 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0232  regulatory protein, FmdB family  40.38 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  40.38 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  37.18 
 
 		 73 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  35.59 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0637  regulatory protein, FmdB family  33.77 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  46.67 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  36.21 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  35 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  46.67 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  36.54 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  45.45 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  32.08 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  34.62 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  40.38 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  42.31 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 141 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  42.31 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  40.35 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  34.62 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  40.35 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3239  regulatory protein, FmdB family  44.19 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.688496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  43.9 
 
 		 70 aa  40.8  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  31.65 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  42.5 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  40.91 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  39.74 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  38.46 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  37.78 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 71 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>