42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3407 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 142 aa  286  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  85.31 
 
 		 141 aa  235  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3239  regulatory protein, FmdB family  66.9 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.688496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4161  FmdB family regulatory protein  55.32 
 
 		 125 aa  158  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1903  FmdB family regulatory protein  47.62 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.056161  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2281  regulatory protein, FmdB family  39.17 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0721  FmdB family regulatory protein  33.58 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.538439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2748  cytochrome c family protein, putative  30.77 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2576  cytochrome c family protein, putative  31.82 
 
 		 162 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00231924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  53.49 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  40.98 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  42 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  42 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  43.48 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  43.18 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  43.86 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  31.08 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  35.8 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  43.18 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  40.43 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  40.43 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  46.51 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  43.48 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1891  FmdB family regulatory protein  46.51 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00708289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  39.58 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  44 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  46.81 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  43.48 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  43.48 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  39.13 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  42.22 
 
 		 104 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  44.19 
 
 		 78 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  43.48 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  44.68 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  49.06 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  35.19 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  40.43 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0029  FmdB family regulatory protein  35.42 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  37.5 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  43.48 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>