35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3239 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3239  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 129 aa  265  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.688496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  68.09 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  66.9 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4161  FmdB family regulatory protein  56.25 
 
 		 125 aa  160  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1903  FmdB family regulatory protein  44.76 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.056161  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2281  regulatory protein, FmdB family  43.4 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2748  cytochrome c family protein, putative  31.54 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2576  cytochrome c family protein, putative  29.57 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00231924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0721  FmdB family regulatory protein  27.59 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.538439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  47.17 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  47.17 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  48.94 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  52.27 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  41.82 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  47.73 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  47.73 
 
 		 104 aa  48.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  47.73 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  45.65 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  37.04 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  46.51 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  46.51 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  44.19 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  40.91 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  42.55 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  37.04 
 
 		 65 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  41.86 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0665  FmdB family regulatory protein  30.3 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000563996  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_640  hypothetical protein  31.06 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000170615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  39.53 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  44.19 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  46.51 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0734  hypothetical protein  30.3 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000750313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  35.09 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1891  FmdB family regulatory protein  46.51 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00708289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0029  FmdB family regulatory protein  35.42 
 
 		 67 aa  40  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>