48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2088 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 79 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2195  FmdB family regulatory protein  59.74 
 
 		 80 aa  98.6  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  56.79 
 
 		 81 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  53.09 
 
 		 81 aa  90.1  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2544  FmdB family regulatory protein  40.24 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  40.58 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  40.68 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  43.14 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  44.19 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  53.49 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  39.29 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  40.82 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  32.31 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  32.31 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  37.29 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1941  FmdB family regulatory protein  35.71 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0534197  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  44.44 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  35.85 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4161  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024614  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  46.67 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  46.67 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2576  cytochrome c family protein, putative  40 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00231924  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  34.88 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  41.86 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  43.4 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  33.96 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  41.86 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  37.78 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0363  regulatory protein, FmdB family  33.93 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.232661  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  33.82 
 
 		 93 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  37.21 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  44.44 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  44.19 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  37.21 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0721  FmdB family regulatory protein  42.31 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.538439  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  35 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  35.21 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1903  FmdB family regulatory protein  35.48 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.056161  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  42.22 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  37.21 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  29.87 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  41.3 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2465  regulatory protein, FmdB family  35.29 
 
 		 106 aa  40  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0532528  hitchhiker  0.00128388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  36.36 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>