20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0721 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0721  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.538439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2576  cytochrome c family protein, putative  75.46 
 
 		 162 aa  261  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00231924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2748  cytochrome c family protein, putative  65.64 
 
 		 181 aa  229  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3176  FmdB family regulatory protein  33.16 
 
 		 190 aa  84.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4161  FmdB family regulatory protein  32.12 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  33.58 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  33.58 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1903  FmdB family regulatory protein  35.85 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.056161  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3239  regulatory protein, FmdB family  27.59 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.688496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0170  hypothetical protein  36.11 
 
 		 369 aa  51.6  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.794251 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2281  regulatory protein, FmdB family  25.56 
 
 		 118 aa  48.5  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  43.48 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  38.18 
 
 		 73 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  43.48 
 
 		 80 aa  41.6  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  38 
 
 		 94 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  42.31 
 
 		 79 aa  41.2  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  39.13 
 
 		 76 aa  40.8  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  39.13 
 
 		 76 aa  40.8  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>