45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2620 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  48.15 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  69.57 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  63.41 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  44.74 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  55.41 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  40.79 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  61.9 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  41.89 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  53.19 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  55.81 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  53.49 
 
 		 65 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  38.98 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  39.19 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  41.82 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  41.82 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  36 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5314  regulatory protein, FmdB family  51.22 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  45 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  35.21 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  33.8 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3239  regulatory protein, FmdB family  40.74 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.688496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  56.1 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4703  hypothetical protein  48.78 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4303  FmdB family regulatory protein  47.5 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  38.89 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  33.8 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  33.8 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0637  regulatory protein, FmdB family  34.72 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  36.49 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  44.19 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  35.21 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  36.49 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  38.96 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  40.74 
 
 		 83 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  44.19 
 
 		 72 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  47.73 
 
 		 80 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3030  regulatory protein, FmdB family  40.35 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2782  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155022  normal  0.0575706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  36.23 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  46.15 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1891  FmdB family regulatory protein  39.22 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00708289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  33.78 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4413  hypothetical protein  46.34 
 
 		 75 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.945619  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>