30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3238 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0420  hypothetical protein  49.33 
 
 		 75 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4303  FmdB family regulatory protein  51.35 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4413  hypothetical protein  48 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.945619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  50.65 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5314  regulatory protein, FmdB family  45.83 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  47.22 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4703  hypothetical protein  45.83 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4252  hypothetical protein  48.68 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79426  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  48.65 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  48.65 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  38.16 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  40.28 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  38.75 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  40.28 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  44.44 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3239  regulatory protein, FmdB family  41.82 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.688496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  45 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  31.08 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  31.08 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  43.48 
 
 		 70 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3109  glutamine amidotransferase, class-II  34.38 
 
 		 117 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  41.03 
 
 		 85 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  41.46 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  43.48 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  43.48 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  42.5 
 
 		 80 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  43.9 
 
 		 95 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>