38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0086 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 81 aa  168  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2195  FmdB family regulatory protein  61.73 
 
 		 80 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  58.97 
 
 		 81 aa  99.4  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  56.79 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2544  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  38.6 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  38.96 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  34.48 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  41.38 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  34.48 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  40.32 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  37.04 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  41.07 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  32.93 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  37.29 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  35.29 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  37.04 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  38.46 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  38.46 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  30.59 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  36.36 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  40.48 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  35.19 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  32.14 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  35.85 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  44.19 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  36.54 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  34.62 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1903  FmdB family regulatory protein  40.82 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.056161  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  39.53 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  39.62 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  39.62 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  28.57 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0665  FmdB family regulatory protein  29.85 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000563996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  38.78 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0734  hypothetical protein  33.96 
 
 		 128 aa  40  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000750313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>