173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0601 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  100 
 
 
97 aa  196  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  59.26 
 
 
112 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  67.65 
 
 
115 aa  104  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  58.24 
 
 
125 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  67.65 
 
 
111 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  67.65 
 
 
111 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  67.65 
 
 
117 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  67.65 
 
 
117 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  67.65 
 
 
117 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  64.86 
 
 
133 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  60.71 
 
 
114 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  61.64 
 
 
113 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  70.97 
 
 
114 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  61.64 
 
 
113 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  64.29 
 
 
113 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  64.29 
 
 
113 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  64.29 
 
 
113 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  64.29 
 
 
113 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  63.24 
 
 
112 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  71.19 
 
 
87 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  70 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3639  FmdB family regulatory protein  69.49 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0572  FmdB family regulatory protein  71.19 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13841  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  58.02 
 
 
112 aa  97.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  66.18 
 
 
83 aa  97.1  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0801  regulatory protein, FmdB family  65.57 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  64.52 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0872  FmdB family regulatory protein  65.57 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616078  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0440  hypothetical protein  53.68 
 
 
86 aa  94.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  52.38 
 
 
104 aa  93.6  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  52.38 
 
 
104 aa  93.6  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  62.9 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  69.49 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  59.42 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  65 
 
 
128 aa  92  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  69.49 
 
 
113 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1295  hypothetical protein  67.8 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  54.17 
 
 
91 aa  90.5  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  63.33 
 
 
108 aa  90.5  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2782  FmdB family regulatory protein  66.13 
 
 
63 aa  90.9  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155022  normal  0.0575706 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  54.17 
 
 
91 aa  90.5  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  58.06 
 
 
108 aa  90.5  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  51.58 
 
 
92 aa  89.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  62.9 
 
 
99 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  55.7 
 
 
95 aa  87  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0437  hypothetical protein  63.33 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  51.14 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  61.67 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  57.63 
 
 
83 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  48.75 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  53.52 
 
 
113 aa  80.1  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  55 
 
 
73 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  56.67 
 
 
73 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  58.33 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  55 
 
 
73 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  55 
 
 
73 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  55 
 
 
73 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  46.67 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  46.67 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  46.25 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000617496  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  54.24 
 
 
81 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  54.84 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  49.25 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  54.24 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  53.33 
 
 
82 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  50.59 
 
 
88 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145953  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  46.05 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0195  regulatory protein, FmdB family  50.85 
 
 
81 aa  70.9  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  49.25 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  50.79 
 
 
81 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  44.19 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  47.76 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  47.37 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  52.54 
 
 
85 aa  67  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  41.33 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  53.7 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  53.7 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  45 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4588  regulatory protein, FmdB family  55.56 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.691856  normal  0.396421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 
73 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  45.33 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0232  regulatory protein, FmdB family  47.37 
 
 
58 aa  62.4  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  41.67 
 
 
71 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  43.37 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  45.61 
 
 
82 aa  61.6  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  47.14 
 
 
85 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  41.89 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0213  FmdB family regulatory protein  40.86 
 
 
98 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.119501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  42.25 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  39.68 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  41.94 
 
 
97 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  41.3 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  41.3 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0029  FmdB family regulatory protein  44.07 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204115  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6324  regulatory protein, FmdB family  37.89 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165247  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  40.35 
 
 
61 aa  57.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  41.03 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0708  FmdB family regulatory protein  40.35 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.001557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0206  hypothetical protein  39.73 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000235601  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>