22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1074 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1074  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 
73 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  64.71 
 
 
72 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1422  FmdB family regulatory protein  43.84 
 
 
70 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1941  FmdB family regulatory protein  40 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0534197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  38.75 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0637  regulatory protein, FmdB family  31.88 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  35.85 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  34.21 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  35.62 
 
 
84 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2441  FmdB transcriptional regulator  44.68 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2195  FmdB family regulatory protein  35.29 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  38.46 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  37.68 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12110  putative regulatory protein, FmdB family  35.19 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.562196  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  34.15 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  46.51 
 
 
81 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0363  regulatory protein, FmdB family  35.09 
 
 
71 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.232661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  44.19 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>