20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1567 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1633  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 68 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1567  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 68 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0637  regulatory protein, FmdB family  37.88 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0829  hypothetical protein  43.48 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000274329  normal  0.31982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2257  regulatory protein, FmdB family  38.1 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  39.13 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2603  regulatory protein, FmdB family  38.03 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  39.29 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  43.14 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1941  FmdB family regulatory protein  33.82 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0534197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0363  regulatory protein, FmdB family  32.35 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.232661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2262  hypothetical protein  42.5 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.545917 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  45 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0195  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 81 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  42.5 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  36 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  29.41 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  30.77 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0708  FmdB family regulatory protein  36 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.001557  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  35.06 
 
 		 77 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>