19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0648 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0648  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 75 aa  150  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2210  hypothetical protein  74.47 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2540  FmdB family regulatory protein  72.34 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0433  FmdB family regulatory protein  62.71 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.186737  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1341  regulatory protein, FmdB family  65.45 
 
 		 73 aa  77  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141907  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29350  putative regulatory protein, FmdB family  65.96 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3419  regulatory protein, FmdB family  63.16 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6110  regulatory protein, FmdB family  65.31 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0363  FmdB family regulatory protein  70.59 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0337  hypothetical protein  41.38 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2441  FmdB transcriptional regulator  44.44 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  43.14 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1721  hypothetical protein  39.13 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.468781  normal  0.898434 
 
 
-
 
NC_002936  DET0734  hypothetical protein  47.62 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000750313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  46.43 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0865  regulatory protein, FmdB family  35 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000475517  normal  0.391737 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  41.27 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_640  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000170615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  42.19 
 
 		 83 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>