More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3538 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3538  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 		 446 aa  889    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2371  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  84.76 
 
 		 447 aa  728    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000288768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  40.24 
 
 		 432 aa  308  9e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  38.55 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  40.91 
 
 		 432 aa  303  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  38.39 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  38.67 
 
 		 433 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 428 aa  289  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  38.43 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4780  d-galactonate transporter  39.49 
 
 		 444 aa  285  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  40.13 
 
 		 440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4964  d-galactonate transporter  36.83 
 
 		 448 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169087  normal  0.027359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2785  d-galactonate transporter  36.83 
 
 		 448 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.0710234 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4220  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 440 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4578  4-hydroxyphenylacetate permease  34.92 
 
 		 458 aa  280  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 433 aa  279  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3708  4-hydroxyphenylacetate transporter  34.69 
 
 		 458 aa  279  8e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.517033 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 444 aa  279  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4811  d-galactonate transporter  37.71 
 
 		 448 aa  279  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00271172  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04224  hypothetical 4-hydroxyphenylacetate permease  34.69 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1066  4-hydroxyphenylacetate permease  34.75 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04190  hypothetical protein  34.69 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1217  4-hydroxyphenylacetate permease  34.75 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 443 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 		 444 aa  277  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 449 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 441 aa  276  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1182  4-hydroxyphenylacetate permease  34.53 
 
 		 458 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1171  4-hydroxyphenylacetate permease  34.53 
 
 		 458 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1202  4-hydroxyphenylacetate permease  34.53 
 
 		 458 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 		 440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 440 aa  273  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 		 445 aa  273  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 439 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 441 aa  272  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  39.6 
 
 		 433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1641  4-hydroxyphenylacetate permease  36.09 
 
 		 455 aa  270  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 435 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2454  4-hydroxyphenylacetate transporter  36.09 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.564928  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 432 aa  269  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  37 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  38.83 
 
 		 437 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2358  4-hydroxyphenylacetate permease  35.86 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.876442  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 		 454 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  37.31 
 
 		 445 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 		 454 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  37.07 
 
 		 442 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 		 440 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 440 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  37.03 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 441 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 454 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 441 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 440 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 437 aa  264  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  38.64 
 
 		 434 aa  263  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 441 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 435 aa  262  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0632  4-hydroxyphenylacetate transporter  34.1 
 
 		 456 aa  262  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.862477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.48 
 
 		 442 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  36.79 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 436 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  38.12 
 
 		 445 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 434 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 440 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4191  4-hydroxyphenylacetate transporter  36.23 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  38.41 
 
 		 434 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  38.41 
 
 		 434 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  38.41 
 
 		 434 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  40.62 
 
 		 431 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 441 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 441 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 459 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 434 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 459 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  36.18 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 431 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 433 aa  257  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 443 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  34 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  39.43 
 
 		 435 aa  257  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 435 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>