119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5211 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5211  type III secretion protein, HrpO family  100 
 
 		 91 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  41.43 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1394  type III secretion protein HrcS  39.74 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3009  HrpO family type III secretion protein  39.02 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2213  type III secretion protein, HrpO family  41.03 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0047  HrpO family type III secretion protein  39.74 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1627  type III secretion inner membrane protein SctS  33.78 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0675  type III secretion inner membrane protein SctS  33.78 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0793494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1958  type III secretion inner membrane protein SctS  33.78 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2277  HrpO family type III secretion protein  33.78 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2194  HrpO family type III secretion protein  33.78 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0638  type III secretion inner membrane protein SctS  33.78 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.16 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0188  Spa9  36.71 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0755  type III secretion inner membrane protein SctS  33.82 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313382  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003361  type III secretion protein YscS  36.25 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  35 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.5 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0859  Hrp conserved HRCS transmembrane protein  40.79 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0274249  hitchhiker  0.00877367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0448  HrpO family type III secretion protein  44 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3017  type III secretion apparatus protein EpaQ  37.88 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000282862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3183  type III secretion apparatus protein EpaQ  37.88 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0847  HrpO family type III secretion protein  37.88 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.693953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4140  type III secretion apparatus protein EpaQ  37.88 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912343 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5927  HrpO family type III secretion protein  35.29 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0431  type III secretion inner membrane protein SctS  36 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0732733  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2001  HrpO family type III secretion protein  36 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1909  HrpO family type III secretion protein  36 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3094  hypothetical protein  48.28 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3079  secretory protein EpaQ  48.28 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3042  EpaQ  48.28 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.230102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3011  EpaQ  48.28 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3199  hypothetical protein  48.28 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1884  type III secretion protein, HrpO family  40.74 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5862  HrpO family type III secretion protein  30.67 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.1 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2005  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.33 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207342  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0111  export protein FliQ  35.19 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131066  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.33 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  34.57 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5645  HrpO family type III secretion protein  30.67 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0584455 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.33 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.77 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.88 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.8 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0122  flagellar biosynthetic protein fliQ  38.03 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.23 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1207  type III secretion protein HrcS  43.59 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.427882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.47 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.15 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0737  type III secretion protein, HrpO family  37.04 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0357891  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  27.85 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.47 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.38 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.47 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0738  type III secretion protein, HrpO family  37.04 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  30.12 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  29.87 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5535  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.25 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  27.27 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  35.62 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.15 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.38 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5152  flagellar biosynthetic protein FliQ  30 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458719  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  25 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.38 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.47 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.62 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.05 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  28.75 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.53 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.88 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4229  HrpO family type III secretion protein  35.48 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.619618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3740  HrpO family type III secretion protein  35.48 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.721629  hitchhiker  0.00976692 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4752  HrpO family type III secretion protein  35.48 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  35.82 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  33.77 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0663  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.94 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.242744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0048  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.31 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.5 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.43 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3511  Type III secretion protein HrpO  33.87 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.124338  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1932  flagellar biosynthesis protein FliQ  26.83 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.618513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4855  HrpO family type III secretion protein  33.87 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1116  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.31 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.46 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0282  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.31 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3813  HrpO family type III secretion protein  29.51 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  28.75 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3928  HrpO family type III secretion protein  29.51 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0689  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.85 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0250879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2605  flagellar biosynthetic protein FliQ  30 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459471  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5429  HrpO family type III secretion protein  33.87 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751272  normal  0.141963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  30 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0700  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.85 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2828  flagellar biosynthetic protein FliQ  30 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.224075 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.29 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0576  type III secretion system protein BsaX  36.11 
 
 		 84 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2078  HrpO family type III secretion protein  36.11 
 
 		 84 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.624451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>