278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4066 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  100 
 
 
91 aa  176  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.88 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.02 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.06 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.75 
 
 
83 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.53 
 
 
89 aa  78.2  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.71 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.7 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.02 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.02 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.95 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.35 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.53 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.86 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.7 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.37 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.18 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.05 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.7 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2005  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.86 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207342  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.02 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.53 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4187  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.64 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.999442  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2975  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.9 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2019  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.05 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.67 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  42.05 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.76 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.08 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.21 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.33 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.33 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2828  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.05 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.224075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2605  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.05 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459471  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.33 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.05 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.21 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.82 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.05 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  40 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.7 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0048  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.53 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0663  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.24 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.242744 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.05 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.77 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1133  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.36 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2216  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.37 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.886542 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.65 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.65 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1038  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.36 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.29 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.47 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  38.82 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.21 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.37 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.11 
 
 
91 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.37 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0689  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.86 
 
 
88 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0250879  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  41.98 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0700  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.86 
 
 
88 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  37.78 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3551  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.24 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.863211 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0737  type III secretion protein, HrpO family  40 
 
 
88 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0357891  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.53 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.67 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.52 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.53 
 
 
87 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.29 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.65 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.48 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0619  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.07 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5152  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.42 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458719  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.71 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5535  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.42 
 
 
88 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.29 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.42 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0155  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.25 
 
 
88 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2730  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.09 
 
 
89 aa  60.5  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0625  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.71 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.29 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.65 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.65 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.95 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0041  export protein FliQ  43.94 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.9 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1116  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.52 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.75 
 
 
89 aa  58.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1117  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.23 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.12 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.65 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.12 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0705  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00473714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.71 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>