277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0233 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  100 
 
 
88 aa  169  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  100 
 
 
88 aa  169  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  64.77 
 
 
88 aa  100  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.86 
 
 
88 aa  87.4  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.37 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0928  flagellar biosynthetic protein FliQ  65.91 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0883861  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.96 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0625  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.05 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0705  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.05 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00473714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0240  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.05 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331629  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2565  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.25 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1193  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.94 
 
 
89 aa  66.6  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.59 
 
 
89 aa  67  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3057  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.95 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.554664  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.95 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832083  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.46 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.14 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1337  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3036  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.35 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.35 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2915  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.95 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.114624  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.36 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.75 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1448  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.95 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115597  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.73 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.36 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02876  flagellar biosynthesis  36.36 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.46 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.26 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.36 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.59 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.42 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  39.44 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.35 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.47 
 
 
89 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.11 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5535  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.35 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 
89 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.53 
 
 
84 aa  62  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.14 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.94 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  38.64 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.94 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.94 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.64 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.55 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.02 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.76 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.64 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3009  HrpO family type III secretion protein  38.57 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1513  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.84 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5152  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.73 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458719  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.76 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2605  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.62 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459471  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2828  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.62 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.224075 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.8 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.93 
 
 
87 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.09 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.62 
 
 
88 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.11 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1629  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.09 
 
 
89 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.37 
 
 
89 aa  60.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3055  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341394  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.73 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.47 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.55 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  37.14 
 
 
86 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.02 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0084  export protein FliQ  49.06 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4752  HrpO family type III secretion protein  31.76 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.73 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4229  HrpO family type III secretion protein  31.76 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.619618  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.51 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  33.33 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3740  HrpO family type III secretion protein  31.76 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.721629  hitchhiker  0.00976692 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2171  flagellar hook-associated protein  42.47 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3985  export protein FliQ  41.54 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.26 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3511  Type III secretion protein HrpO  31.76 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.124338  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.82 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4855  HrpO family type III secretion protein  31.76 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121138  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5429  HrpO family type III secretion protein  31.76 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751272  normal  0.141963 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0215  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.47 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.73 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0090  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.17 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.69 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.51 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3665  export protein FliQ  47.17 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  50 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44431  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1671  flagellar biosynthesis protein FliQ  50 
 
 
89 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>