269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1550 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  100 
 
 		 89 aa  174  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  85.39 
 
 		 89 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  86.52 
 
 		 89 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  86.52 
 
 		 89 aa  153  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  83.15 
 
 		 89 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  82.02 
 
 		 89 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  82.02 
 
 		 89 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  74.16 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  74.16 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3880  flagellar biosynthesis protein FliQ  76.4 
 
 		 89 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  56.18 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  59.55 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  59.55 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  58.43 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  58.43 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  58.43 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2171  flagellar hook-associated protein  59.55 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  58.43 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2565  flagellar biosynthetic protein FliQ  59.55 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3057  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.3 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.554664  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1448  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.3 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.3 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2915  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.3 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.114624  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  55.68 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.69 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1337  flagellar biosynthetic protein FliQ  56.18 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  54.55 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1193  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.06 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1513  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.68 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  51.14 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  51.14 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0215  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3055  flagellar biosynthetic protein FliQ  56.18 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341394  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02876  flagellar biosynthesis  53.93 
 
 		 89 aa  97.1  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1629  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3036  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 		 89 aa  95.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.44 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.44 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4423  export protein FliQ  50.56 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.844817 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0166  flagellar biosynthetic protein FliQ, putative  51.69 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3482  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.38 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3594  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.69 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.07 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3985  export protein FliQ  48.15 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3665  export protein FliQ  46.59 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.24 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.24 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0090  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.5 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.24 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.06 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.34 
 
 		 83 aa  84.3  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0625  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0084  export protein FliQ  54.32 
 
 		 89 aa  84.3  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1377  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.3 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.986753  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0705  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00473714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0240  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331629  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.82 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.71 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4647  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189721  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1551  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.05 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.45 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.43 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2958  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1262  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1139  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00184506  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2196  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15457  normal  0.786149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2138  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.74 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2403  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2303  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1165  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1356  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.31 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2161  flagellar biosynthesis protein FliQ  51.69 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0741  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.31 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.153743  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5302  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.88 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.84251  normal  0.100483 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1372  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.558893  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1880  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2586  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.45 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24120  flagellar biosynthetic protein  44.94 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169553  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.91 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1332  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.498706  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.2 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.33 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.33 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3781  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.85 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0154  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.85 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.773854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0576  flagellar biosynthesis protein  46.84 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.29 
 
 		 89 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.29 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>