246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2828 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2605  flagellar biosynthetic protein FliQ  100 
 
 
88 aa  166  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459471  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2828  flagellar biosynthetic protein FliQ  100 
 
 
88 aa  166  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.224075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  98.86 
 
 
88 aa  165  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  86.36 
 
 
88 aa  147  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5152  flagellar biosynthetic protein FliQ  85.23 
 
 
88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458719  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5535  flagellar biosynthetic protein FliQ  85.23 
 
 
88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  55.17 
 
 
87 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1135  flagellar biosynthesis protein FliQ  55.17 
 
 
87 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5494  flagellar biosynthesis protein FliQ  58.62 
 
 
87 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178989  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1520  flagellar biosynthesis protein FliQ  57.47 
 
 
87 aa  95.9  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00598342  normal  0.364566 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.87 
 
 
87 aa  93.6  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.94 
 
 
87 aa  93.6  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1932  flagellar biosynthesis protein FliQ  54.12 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.618513  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4408  flagellar biosynthesis protein FliQ  56.32 
 
 
87 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3774  flagellar biosynthesis protein FliQ  55.17 
 
 
87 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023221  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1696  flagellar biosynthesis protein FliQ  55.17 
 
 
87 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  48 
 
 
84 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0122  flagellar biosynthetic protein fliQ  45.35 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.33 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.72 
 
 
83 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.68 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1133  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.21 
 
 
88 aa  70.1  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.79 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1038  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.21 
 
 
88 aa  70.1  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.44 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3551  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.38 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.863211 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1116  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.98 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4187  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.98 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.999442  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.86 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.98 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.74 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0048  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.44 
 
 
88 aa  67  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0663  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.68 
 
 
88 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.242744 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.14 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.53 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.46 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0273  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.68 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.941775  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  46.05 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.53 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.7 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0700  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.68 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0689  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.68 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0250879  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.81 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.76 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.11 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.38 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.48 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 
88 aa  62  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 
88 aa  62  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.04 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.88 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.75 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.96 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.55 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  54.72 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.25 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.68 
 
 
91 aa  61.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.25 
 
 
89 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  47.69 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.48 
 
 
89 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  36.71 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4195  export protein FliQ  36.78 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.93 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.25 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0282  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.27 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700739  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1701  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.38 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2113  export protein FliQ  38.03 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.85 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3250  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.16 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.83 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.47 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3441  export protein FliQ family 3  40.85 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.47 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.91 
 
 
88 aa  57.4  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2019  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.02 
 
 
89 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2730  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.5 
 
 
89 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  50 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1117  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.27 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1328  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.703831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.97 
 
 
89 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2989  export protein FliQ  36.36 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.47 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.1 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2975  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2603  export protein FliQ  36.36 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.627445  hitchhiker  0.000444026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.96 
 
 
89 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.97 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.71 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2216  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.75 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.886542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  44.83 
 
 
92 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.02 
 
 
84 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.94 
 
 
88 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.71 
 
 
89 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.62 
 
 
89 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.28 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2962  export protein FliQ  40.58 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.237465 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2131  export protein FliQ  32.5 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.75 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>