215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1117 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1117  flagellar biosynthesis protein FliQ  100 
 
 		 88 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0689  flagellar biosynthesis protein FliQ  65.91 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0250879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0700  flagellar biosynthesis protein FliQ  65.91 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0663  flagellar biosynthesis protein FliQ  64.77 
 
 		 88 aa  124  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.242744 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1116  flagellar biosynthesis protein FliQ  64.77 
 
 		 88 aa  123  8.000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1133  flagellar biosynthesis protein FliQ  65.91 
 
 		 88 aa  121  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1038  flagellar biosynthesis protein FliQ  65.91 
 
 		 88 aa  121  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0282  flagellar biosynthesis protein FliQ  67.05 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4187  flagellar biosynthesis protein FliQ  64.77 
 
 		 88 aa  120  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.999442  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0273  flagellar biosynthesis protein FliQ  63.64 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.941775  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0048  flagellar biosynthesis protein FliQ  64.77 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1701  flagellar biosynthesis protein FliQ  71.59 
 
 		 88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  62.5 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  56.82 
 
 		 88 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  61.36 
 
 		 88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3551  flagellar biosynthesis protein FliQ  61.36 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.863211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6512  flagellar biosynthesis protein FliQ  64.77 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1328  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.84 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.703831  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2989  export protein FliQ  48.84 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1135  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.83 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.98 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2603  export protein FliQ  47.73 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.627445  hitchhiker  0.000444026 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.68 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2113  export protein FliQ  50 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1932  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.53 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.618513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.05 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.53 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.02 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.24 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3774  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.53 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4195  export protein FliQ  41.98 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3250  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.74 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.37 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4408  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.53 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.21 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  34.12 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.72 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0064  flagellar protein FliQ  39.13 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1520  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.23 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00598342  normal  0.364566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1699  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.13 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1652  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.13 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212217  normal  0.924437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5494  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.08 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.47 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1696  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.38 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.4 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.79 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  43.53 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.03 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5152  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.74 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458719  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.27 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5535  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.74 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.05 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.12 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  35.23 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.71 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.88 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.72 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.9 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.62 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.58 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3441  export protein FliQ family 3  31.25 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.8 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.47 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2975  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.29 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  33.33 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.14 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.4 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  33.72 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.23 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.94 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.33 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2605  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.25 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459471  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2828  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.25 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.224075 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003361  type III secretion protein YscS  34.52 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.4 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3665  export protein FliQ  33.72 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.25 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.23 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.21 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.23 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.5 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  34.15 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.95 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.43 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  41.54 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.89 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1332  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.48 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.498706  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  36.71 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.77 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.95 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0216  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  34.09 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0737  type III secretion protein, HrpO family  35 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0357891  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0122  flagellar biosynthetic protein fliQ  37.14 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  31.76 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.76 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.59 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>