221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01725 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  100 
 
 		 88 aa  166  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003361  type III secretion protein YscS  89.77 
 
 		 88 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  72.73 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42630  putative translocation protein in type III secretion  68.18 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  61.43 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3009  HrpO family type III secretion protein  58.57 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2213  type III secretion protein, HrpO family  47.56 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1975  HrpO family type III secretion protein  50.57 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2279  HrpO family type III secretion protein  50.57 
 
 		 89 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0217688  normal  0.613678 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0737  type III secretion protein, HrpO family  48.28 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0357891  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0738  type III secretion protein, HrpO family  47.13 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0755  type III secretion inner membrane protein SctS  42.86 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313382  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4140  type III secretion apparatus protein EpaQ  47.95 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912343 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3183  type III secretion apparatus protein EpaQ  47.95 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5927  HrpO family type III secretion protein  46.75 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3017  type III secretion apparatus protein EpaQ  47.95 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000282862  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0847  HrpO family type III secretion protein  47.95 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.693953  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1627  type III secretion inner membrane protein SctS  41.56 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0431  type III secretion inner membrane protein SctS  51.28 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0732733  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0675  type III secretion inner membrane protein SctS  41.56 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0793494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1958  type III secretion inner membrane protein SctS  41.56 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2001  HrpO family type III secretion protein  51.28 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2277  HrpO family type III secretion protein  41.56 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1909  HrpO family type III secretion protein  51.28 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2194  HrpO family type III secretion protein  41.56 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0638  type III secretion inner membrane protein SctS  41.56 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1884  type III secretion protein, HrpO family  47.62 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  42.86 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0663  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.48 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.242744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.1 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0700  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.29 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0689  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.29 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0250879  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1394  type III secretion protein HrcS  43.9 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.38 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0047  HrpO family type III secretion protein  45.12 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5862  HrpO family type III secretion protein  39.74 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5645  HrpO family type III secretion protein  39.74 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0584455 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4187  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.53 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.999442  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.48 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.48 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.82 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0188  Spa9  41.89 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1116  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.29 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.08 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  41.38 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3928  HrpO family type III secretion protein  49.4 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3901  HrpO family type III secretion protein  49.4 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4229  HrpO family type III secretion protein  44.05 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.619618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3813  HrpO family type III secretion protein  49.4 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4752  HrpO family type III secretion protein  44.05 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3199  hypothetical protein  43.84 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1133  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.37 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5429  HrpO family type III secretion protein  44.05 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751272  normal  0.141963 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3511  Type III secretion protein HrpO  44.05 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.124338  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4855  HrpO family type III secretion protein  44.05 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3079  secretory protein EpaQ  43.84 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3094  hypothetical protein  43.84 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227006 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3740  HrpO family type III secretion protein  44.05 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.721629  hitchhiker  0.00976692 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3042  EpaQ  43.84 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.230102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3011  EpaQ  43.84 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1038  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.37 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.48 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0282  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.1 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.88 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.65 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0273  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.21 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.941775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  34.48 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  39.08 
 
 		 91 aa  57  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.78 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  36.25 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.08 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0448  HrpO family type III secretion protein  45.45 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100595 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.98 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0048  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.72 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.13 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1117  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.72 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.48 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.53 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.68 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5211  type III secretion protein, HrpO family  35 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.96 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.11 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.72 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.48 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1932  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.9 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.618513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.47 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  37.93 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.79 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  29.89 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1207  type III secretion protein HrcS  43.9 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.427882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.47 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1135  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.77 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0744  export protein FliQ  41.98 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0254448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.21 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  29.55 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.29 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.23 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>