134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3079 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A3199  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  166  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3011  EpaQ  100 
 
 
86 aa  166  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3094  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  166  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000227006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3079  secretory protein EpaQ  100 
 
 
86 aa  166  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3042  EpaQ  100 
 
 
86 aa  166  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.230102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4140  type III secretion apparatus protein EpaQ  68.6 
 
 
86 aa  124  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000912343 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3017  type III secretion apparatus protein EpaQ  68.6 
 
 
86 aa  124  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000282862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3183  type III secretion apparatus protein EpaQ  68.6 
 
 
86 aa  124  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0847  HrpO family type III secretion protein  68.6 
 
 
86 aa  124  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.693953  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0188  Spa9  69.14 
 
 
86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  56.52 
 
 
86 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1535  type III secretion system protein BsaX  54.22 
 
 
84 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164439  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0576  type III secretion system protein BsaX  54.22 
 
 
84 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179299  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0837  type III secretion system protein BsaX  54.22 
 
 
84 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.392473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2069  type III secretion system protein BsaX  54.22 
 
 
84 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2166  HrpO family type III secretion protein  54.22 
 
 
84 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.770175  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2078  HrpO family type III secretion protein  54.22 
 
 
84 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.624451  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0749  type III secretion system protein BsaX  54.22 
 
 
84 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.685572  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3009  HrpO family type III secretion protein  55.07 
 
 
86 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  45.95 
 
 
88 aa  67  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  42.03 
 
 
94 aa  60.5  0.000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2213  type III secretion protein, HrpO family  48.33 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  43.84 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003361  type III secretion protein YscS  41.89 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.44 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.76 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.86 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.62 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1394  type III secretion protein HrcS  39.39 
 
 
88 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.33 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0047  HrpO family type III secretion protein  39.39 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5211  type III secretion protein, HrpO family  48.28 
 
 
91 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221369  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3901  HrpO family type III secretion protein  46.15 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.52 
 
 
89 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.5 
 
 
89 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3813  HrpO family type III secretion protein  46.15 
 
 
93 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3928  HrpO family type III secretion protein  46.15 
 
 
93 aa  50.4  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4229  HrpO family type III secretion protein  38.89 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.619618  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.21 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3740  HrpO family type III secretion protein  38.89 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.721629  hitchhiker  0.00976692 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.21 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4752  HrpO family type III secretion protein  38.89 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.11 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0111  export protein FliQ  43.06 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131066  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0431  type III secretion inner membrane protein SctS  32.94 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0732733  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.13 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3511  Type III secretion protein HrpO  38.89 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.124338  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4855  HrpO family type III secretion protein  38.89 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121138  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2001  HrpO family type III secretion protein  32.94 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1909  HrpO family type III secretion protein  32.94 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1884  type III secretion protein, HrpO family  46.67 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5429  HrpO family type III secretion protein  38.89 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751272  normal  0.141963 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.06 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42630  putative translocation protein in type III secretion  47.3 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355777  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.19 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.77 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.19 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1627  type III secretion inner membrane protein SctS  28.92 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0675  type III secretion inner membrane protein SctS  28.92 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0793494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1958  type III secretion inner membrane protein SctS  28.92 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2277  HrpO family type III secretion protein  28.92 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2194  HrpO family type III secretion protein  28.92 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0638  type III secretion inner membrane protein SctS  28.92 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0755  type III secretion inner membrane protein SctS  29.27 
 
 
87 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313382  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  35.71 
 
 
89 aa  47  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.66 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0041  export protein FliQ  46 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0448  HrpO family type III secretion protein  39.47 
 
 
87 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.100595 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.65 
 
 
89 aa  47  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1207  type III secretion protein HrcS  40.91 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.427882 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.13 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  35.53 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5862  HrpO family type III secretion protein  29.27 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  36.76 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1975  HrpO family type III secretion protein  48.89 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1751  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.68 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.27 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.31 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.24 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.43 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2279  HrpO family type III secretion protein  48.89 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0217688  normal  0.613678 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.71 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5645  HrpO family type III secretion protein  28.05 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0584455 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.88 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.68 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.44 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.88 
 
 
89 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5927  HrpO family type III secretion protein  32.93 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2605  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.33 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459471  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2828  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.33 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.224075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.76 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.88 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.33 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.58 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.84 
 
 
89 aa  42.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.8 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.36 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>