86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0111 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0111  export protein FliQ  100 
 
 		 79 aa  150  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131066  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  43.66 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3009  HrpO family type III secretion protein  45.07 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  34.94 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003361  type III secretion protein YscS  38.16 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  43.84 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  37.66 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  38.16 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3011  EpaQ  43.06 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3199  hypothetical protein  43.06 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3042  EpaQ  43.06 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.230102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3079  secretory protein EpaQ  43.06 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3094  hypothetical protein  43.06 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5211  type III secretion protein, HrpO family  35.19 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.58 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.84 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0048  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.21 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.18 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.25 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2213  type III secretion protein, HrpO family  41.82 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0188  Spa9  36.99 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.89 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.62 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.23 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.38 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.43 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1520  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.66 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00598342  normal  0.364566 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.38 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4195  export protein FliQ  33.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.58 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.24 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.67 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.25 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5535  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.76 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5927  HrpO family type III secretion protein  35.94 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.21 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2828  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.76 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.224075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2605  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.76 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459471  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3183  type III secretion apparatus protein EpaQ  35.62 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1627  type III secretion inner membrane protein SctS  25.68 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878926  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0847  HrpO family type III secretion protein  35.62 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.693953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1135  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.47 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0675  type III secretion inner membrane protein SctS  25.68 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0793494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2194  HrpO family type III secretion protein  25.68 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3017  type III secretion apparatus protein EpaQ  35.62 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000282862  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1958  type III secretion inner membrane protein SctS  25.68 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4140  type III secretion apparatus protein EpaQ  35.62 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912343 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2277  HrpO family type III secretion protein  25.68 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2962  export protein FliQ  31.34 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.237465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.48 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0638  type III secretion inner membrane protein SctS  25.68 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.72 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.31 
 
 		 89 aa  42  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.14 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.94 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  27.4 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  27.4 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.76 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5152  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.9 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458719  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1116  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.89 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4752  HrpO family type III secretion protein  35.53 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0122  flagellar biosynthetic protein fliQ  35.9 
 
 		 89 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4229  HrpO family type III secretion protein  35.53 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.619618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1932  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.77 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.618513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2113  export protein FliQ  29.87 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.18 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0755  type III secretion inner membrane protein SctS  24.32 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.92 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  44.68 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  32 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.21 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3740  HrpO family type III secretion protein  35.53 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.721629  hitchhiker  0.00976692 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  42 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  40.82 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1884  type III secretion protein, HrpO family  47.27 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.92 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0047  HrpO family type III secretion protein  38.18 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.14 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.89 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4855  HrpO family type III secretion protein  34.21 
 
 		 92 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3511  Type III secretion protein HrpO  34.21 
 
 		 92 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.124338  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2603  export protein FliQ  32.84 
 
 		 88 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.627445  hitchhiker  0.000444026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  44 
 
 		 88 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5429  HrpO family type III secretion protein  34.21 
 
 		 92 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751272  normal  0.141963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>