286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0424 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  100 
 
 		 89 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  87.64 
 
 		 89 aa  157  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  79.78 
 
 		 89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  76.4 
 
 		 89 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3289  flagellar biosynthetic protein FliQ  82.02 
 
 		 89 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3823  flagellar biosynthetic protein FliQ  74.16 
 
 		 89 aa  121  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3907  flagellar biosynthetic protein FliQ  74.16 
 
 		 89 aa  121  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325384 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  56.25 
 
 		 91 aa  93.6  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.28 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.43 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.43 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.43 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2005  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.38 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207342  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  46.34 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.19 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.62 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.75 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.98 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.43 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.21 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.38 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.44 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.25 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.86 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.91 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2730  flagellar biosynthetic protein FliQ  54.32 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.35 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.21 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.38 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.75 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2216  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.85 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.886542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.44 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0155  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.81 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.98 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.21 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.03 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.83 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.68 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.51 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44431  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.21 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0203  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.35 
 
 		 88 aa  72  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 		 89 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2918  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.198068 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.75 
 
 		 89 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0216  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.91 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397416  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1847  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.94 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.33 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2019  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.51 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.1 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1671  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.94 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.23 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.05 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.84 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1932  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.21 
 
 		 87 aa  70.1  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.618513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.33 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  39.08 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  35.63 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.3 
 
 		 89 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.62 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.08 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.02 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.47 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.14 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  36.9 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0619  flagellar biosynthesis protein FliQ  50 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.37 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.33 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.29 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.2 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.23 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.21 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0787  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000782848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.5 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5535  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.7 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2975  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.05 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0280  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.38 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.8 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5152  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.25 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458719  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.1 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  41.98 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  40.74 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.63 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.48 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.48 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.16 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1193  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.71 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1356  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.5 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.8 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4384  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.84 
 
 		 89 aa  62  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1337  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.52 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.44 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.44 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.44 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24120  flagellar biosynthetic protein  51.72 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>