249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0041 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0041  export protein FliQ  100 
 
 		 82 aa  155  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.25 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.05 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  52.46 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.67 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.83 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.23 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  43.24 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.69 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.69 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.28 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.62 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.18 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4195  export protein FliQ  40 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  51.72 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.65 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.65 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  43.94 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.82 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.28 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.73 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.1 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.33 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.62 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  50 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.92 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.3 
 
 		 84 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  49.3 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.15 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.03 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.06 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.16 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.18 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0215  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.28 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.28 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  50 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.94 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.71 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.15 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.66 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0155  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.54 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.16 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  50 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.15 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  43.28 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.61 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.68 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.98 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.9 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2975  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.73 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0619  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.42 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.73 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.85 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.25 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  40.79 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1133  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.14 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4187  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.06 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.999442  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.62 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0064  flagellar protein FliQ  41.18 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.39 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1699  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.18 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.27 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1038  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.14 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.89 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44431  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1652  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.86 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212217  normal  0.924437 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.43 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.67 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.67 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3441  export protein FliQ family 3  35.29 
 
 		 91 aa  52  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  54 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1932  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.62 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.618513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0576  flagellar biosynthesis protein  51.56 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.28 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2131  export protein FliQ  41.18 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0216  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.75 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3250  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.3 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1847  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.89 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2113  export protein FliQ  48.94 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1671  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.89 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.92 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.12 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.38 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.15 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.38 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0280  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.28 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2005  flagellar biosynthesis protein FliQ  45 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207342  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0166  flagellar biosynthetic protein FliQ, putative  39.06 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.48 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.89 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.89 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1117  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.36 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2962  export protein FliQ  57.14 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.237465 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0203  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.59 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.92 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4647  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.9 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189721  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  44 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3183  type III secretion apparatus protein EpaQ  45.16 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.92 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>