244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0216 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0216  flagellar biosynthetic protein FliQ  100 
 
 		 93 aa  179  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  69.32 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.57 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.08 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.02 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.38 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.83 
 
 		 89 aa  76.6  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.23 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.05 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.32 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.23 
 
 		 89 aa  72  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.86 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.91 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3036  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.38 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02876  flagellar biosynthesis  37.93 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.53 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.71 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.08 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.53 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.17 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.48 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.58 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.77 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.7 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.74 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.71 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.38 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.38 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.38 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.75 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.18 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.23 
 
 		 89 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.29 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.18 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.18 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.53 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1193  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.23 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.23 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2915  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.23 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.114624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3057  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.23 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.554664  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.25 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1448  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.23 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.95 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3594  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3907  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.7 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325384 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3823  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.7 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.64 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2565  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.93 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.48 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1337  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.08 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  51.47 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1629  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.78 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.39 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.22 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0741  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.24 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.153743  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  45 
 
 		 91 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0064  flagellar protein FliQ  40.91 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.63 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1699  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.91 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.1 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0273  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.89 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.941775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.18 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24120  flagellar biosynthetic protein  43.68 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3880  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.9 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1652  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.91 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212217  normal  0.924437 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1513  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.05 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2918  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.91 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.198068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.35 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3055  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.18 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341394  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  38.55 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1332  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.05 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.498706  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4647  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.02 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189721  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  38.82 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.97 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  38.55 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2113  export protein FliQ  41.25 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.75 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2958  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.63 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3250  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.1 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.63 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.27 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2403  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.78 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2303  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.78 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2196  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.48 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15457  normal  0.786149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.36 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3665  export protein FliQ  34.21 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2216  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.77 
 
 		 89 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.886542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>