285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2010 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  100 
 
 
90 aa  179  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  71.11 
 
 
90 aa  138  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2975  flagellar biosynthetic protein FliQ  68.89 
 
 
91 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  55.56 
 
 
90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.56 
 
 
91 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  54.55 
 
 
92 aa  99.4  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  47.73 
 
 
91 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.71 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.53 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.35 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.2 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.44 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.17 
 
 
83 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.67 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.1 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0067  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.11 
 
 
91 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.21 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2005  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.51 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207342  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1117  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.05 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.08 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.47 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1332  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.498706  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.08 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.08 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.78 
 
 
89 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.29 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.48 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.18 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0273  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.48 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.941775  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.78 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.75 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2113  export protein FliQ  39.53 
 
 
88 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.21 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0216  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.22 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397416  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.88 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.76 
 
 
89 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.96 
 
 
89 aa  62  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.88 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.63 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0041  export protein FliQ  47.83 
 
 
82 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  45.35 
 
 
90 aa  62  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.33 
 
 
89 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.63 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.58 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1932  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.29 
 
 
87 aa  61.6  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.618513  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0576  flagellar biosynthesis protein  40.45 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.46 
 
 
89 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.94 
 
 
88 aa  61.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.21 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.34 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.53 
 
 
87 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.21 
 
 
88 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.88 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 
88 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.63 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.34 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0155  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.91 
 
 
88 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.83 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3057  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.58 
 
 
89 aa  59.3  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.554664  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0282  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.37 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700739  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0663  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.05 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.242744 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2915  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.58 
 
 
89 aa  59.3  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.114624  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3880  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.58 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.58 
 
 
89 aa  59.3  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832083  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0700  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.88 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0689  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.88 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0250879  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2603  export protein FliQ  40 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.627445  hitchhiker  0.000444026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1448  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.58 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115597  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.76 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.76 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.76 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.34 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.28 
 
 
89 aa  58.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1847  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.96 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.9 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.72 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2565  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.46 
 
 
89 aa  57.8  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1671  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.96 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  32.05 
 
 
89 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.05 
 
 
89 aa  57.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  29.21 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1328  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.703831  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4195  export protein FliQ  35.44 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2989  export protein FliQ  40 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.36 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44431  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.52 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.56 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.34 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.34 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.71 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>