212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3055 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3055  flagellar biosynthetic protein FliQ  100 
 
 		 89 aa  170  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341394  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1629  flagellar biosynthetic protein FliQ  92.13 
 
 		 89 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1337  flagellar biosynthetic protein FliQ  82.02 
 
 		 89 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1193  flagellar biosynthetic protein FliQ  83.15 
 
 		 89 aa  149  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2565  flagellar biosynthetic protein FliQ  78.65 
 
 		 89 aa  141  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1448  flagellar biosynthetic protein FliQ  76.4 
 
 		 89 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3057  flagellar biosynthetic protein FliQ  75.28 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.554664  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  75.28 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2915  flagellar biosynthetic protein FliQ  75.28 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.114624  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  75.28 
 
 		 89 aa  137  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  74.16 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  74.16 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  74.16 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  71.91 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1377  flagellar biosynthetic protein FliQ  85.39 
 
 		 89 aa  130  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.986753  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02876  flagellar biosynthesis  62.92 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  57.95 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  57.95 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3036  flagellar biosynthetic protein FliQ  59.55 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  57.95 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.41 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1513  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.68 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  56.18 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1372  flagellar biosynthetic protein FliQ  86.52 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.558893  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  56.18 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 		 89 aa  97.1  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.81 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  52.81 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.69 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  51.69 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.81 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.81 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3985  export protein FliQ  48.31 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3482  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.31 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.31 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0215  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.6 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3665  export protein FliQ  48.31 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3880  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2171  flagellar hook-associated protein  46.07 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0090  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3594  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0166  flagellar biosynthetic protein FliQ, putative  50.6 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0084  export protein FliQ  46.07 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4423  export protein FliQ  42.7 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.844817 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.77 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.2 
 
 		 89 aa  70.1  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.96 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0625  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.68 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4647  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189721  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0705  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.68 
 
 		 90 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00473714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0240  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.68 
 
 		 90 aa  67  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331629  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.77 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.83 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.83 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.83 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.59 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.37 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.71 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.96 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.71 
 
 		 89 aa  62  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.33 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.47 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0216  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.18 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.21 
 
 		 89 aa  60.1  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1880  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.83 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1332  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.33 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.498706  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.34 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.65 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.83 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.48 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2586  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.58 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.29 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.58 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.89 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.36 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44431  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.04 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0741  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.08 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.153743  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0619  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1551  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.46 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.58 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.21 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0203  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.76 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1847  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.23 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2958  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.71 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.46 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1671  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.23 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  29.07 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.34 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1356  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.89 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>