282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0156 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  100 
 
 
91 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  47.19 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  52.81 
 
 
91 aa  87.8  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.43 
 
 
90 aa  87.8  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  44.83 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.44 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  45.98 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.56 
 
 
83 aa  80.5  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.53 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2975  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.43 
 
 
91 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.73 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.45 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.51 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.91 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.98 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0048  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.05 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.45 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  45.35 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.35 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0689  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.05 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0250879  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.64 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0700  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.05 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.96 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.78 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.2 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.45 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0663  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.86 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.242744 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.35 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  50 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.36 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1787  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.78 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1590  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.78 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1554  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.78 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.119136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1543  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.78 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1713  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.78 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.83 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1764  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.78 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.08 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.71 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1842  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.78 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0194096  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2005  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.63 
 
 
88 aa  67  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207342  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.96 
 
 
89 aa  67  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.29 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3482  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.26 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.78 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3985  export protein FliQ  42.62 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.36 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.2 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0084  export protein FliQ  44.26 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0090  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.18 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.67 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00606324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1117  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.37 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.64 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0273  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.37 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.941775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.63 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.77 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.77 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3665  export protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  43.18 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.18 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.77 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.05 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.05 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1337  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 
89 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.05 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1193  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.09 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.71 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.29 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.05 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.77 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.64 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2216  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.886542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2828  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.68 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.224075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2605  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.68 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459471  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.68 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.1 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1332  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.32 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.498706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3611  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.67 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.456033  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1701  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.9 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.1 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1590  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.56 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.577091  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2565  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1733  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.67 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2259  export protein FliQ family 3  49.15 
 
 
60 aa  60.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.206575  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1135  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.86 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.45 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4187  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.48 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.999442  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1448  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.09 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115597  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3057  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.09 
 
 
89 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.554664  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1116  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.1 
 
 
88 aa  60.5  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>