265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4354 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  100 
 
 
89 aa  173  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  98.88 
 
 
89 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  96.63 
 
 
89 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  93.26 
 
 
89 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  85.39 
 
 
89 aa  155  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  80.9 
 
 
89 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  80.9 
 
 
89 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  77.53 
 
 
89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  79.78 
 
 
89 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3880  flagellar biosynthesis protein FliQ  78.65 
 
 
89 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  66.29 
 
 
89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  66.29 
 
 
89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2171  flagellar hook-associated protein  61.8 
 
 
89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  59.09 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  57.3 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0215  flagellar biosynthetic protein FliQ  60.67 
 
 
90 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  56.82 
 
 
89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.3 
 
 
89 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1513  flagellar biosynthetic protein FliQ  59.09 
 
 
89 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.06 
 
 
89 aa  104  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2565  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.3 
 
 
89 aa  103  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  103  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  103  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  103  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  54.55 
 
 
89 aa  104  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.41 
 
 
89 aa  103  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3057  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.554664  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1448  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115597  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2915  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.114624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1193  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  100  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0166  flagellar biosynthetic protein FliQ, putative  59.55 
 
 
90 aa  99.4  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02876  flagellar biosynthesis  53.93 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1337  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3036  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0090  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.32 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3055  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341394  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3985  export protein FliQ  53.09 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3482  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.85 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1629  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.69 
 
 
89 aa  94  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3665  export protein FliQ  50 
 
 
89 aa  94  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3594  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.06 
 
 
89 aa  94  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4423  export protein FliQ  50.56 
 
 
90 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.844817 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0084  export protein FliQ  56.1 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0625  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
90 aa  85.9  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.34 
 
 
83 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0240  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331629  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4647  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189721  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0705  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00473714  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2958  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  82  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.32 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.91 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.2 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 
89 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1377  flagellar biosynthetic protein FliQ  56.18 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.986753  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2303  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2403  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1551  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2196  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15457  normal  0.786149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2138  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1139  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00184506  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1262  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1618  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.23 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1880  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2586  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1372  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.558893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.57 
 
 
89 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.44 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.91 
 
 
89 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.33 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1165  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24120  flagellar biosynthetic protein  43.82 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169553  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2161  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1332  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.498706  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0741  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.153743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1356  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.11 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.79 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1699  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000286094  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2182  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000314942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1235  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000102862  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1070  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1693  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000125927  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000496508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2726  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00753995  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2143  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.133607  hitchhiker  0.00525204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>