231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04966 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  100 
 
 
89 aa  176  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  100 
 
 
89 aa  176  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3985  export protein FliQ  67.44 
 
 
89 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  66.29 
 
 
89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  66.29 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3482  flagellar biosynthetic protein FliQ  65.12 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3665  export protein FliQ  63.64 
 
 
89 aa  114  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  64.04 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  64.04 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0090  flagellar biosynthetic protein FliQ  67.44 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3594  flagellar biosynthetic protein FliQ  65.17 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  59.55 
 
 
89 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  59.55 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  59.55 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0084  export protein FliQ  68.6 
 
 
89 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  60.67 
 
 
89 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  58.43 
 
 
89 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  58.43 
 
 
89 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  55.29 
 
 
89 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  54.12 
 
 
89 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.94 
 
 
89 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3880  flagellar biosynthesis protein FliQ  62.92 
 
 
89 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  54.12 
 
 
89 aa  100  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2565  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  100  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2171  flagellar hook-associated protein  55.06 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3057  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.554664  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1448  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115597  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2915  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.114624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.69 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.69 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.69 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.3 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.3 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.06 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1513  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.41 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1193  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.69 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1337  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.56 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0215  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.69 
 
 
90 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3055  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341394  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4423  export protein FliQ  53.93 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.844817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1629  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.56 
 
 
89 aa  94  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02876  flagellar biosynthesis  48.31 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3036  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0166  flagellar biosynthetic protein FliQ, putative  50.56 
 
 
90 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0625  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0705  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00473714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0240  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331629  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4647  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189721  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  73.6  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.33 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1377  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.56 
 
 
89 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.986753  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.33 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2958  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1372  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.69 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.558893  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1139  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00184506  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2196  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15457  normal  0.786149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2138  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1262  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1618  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 
89 aa  67  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1356  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2403  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.18 
 
 
83 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.63 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2303  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.82 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.08 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0741  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.153743  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.03 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.64 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1551  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.33 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.96 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.96 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1880  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.33 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.64 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2586  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.2 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.64 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.61 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1332  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.498706  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 
84 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2143  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.133607  hitchhiker  0.00525204 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.83 
 
 
89 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0064  flagellar protein FliQ  43.06 
 
 
88 aa  59.3  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1165  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.2 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0576  flagellar biosynthesis protein  50.82 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1699  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.33 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000893179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>