256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1096 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  100 
 
 		 84 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.15 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.68 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.44 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.44 
 
 		 89 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.44 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  50 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.44 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.44 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.5 
 
 		 89 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.21 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.8 
 
 		 89 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.33 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.27 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.98 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.98 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  50 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.04 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.8 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.9 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.8 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.02 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.31 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.44 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.68 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.51 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3880  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.15 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.54 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.75 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.8 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.51 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.68 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.21 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.74 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.5 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  50 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.98 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  39.02 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  43.21 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.51 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.75 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.04 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.24 
 
 		 89 aa  63.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1135  flagellar biosynthesis protein FliQ  51.52 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.86 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.02 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.77 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.75 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4384  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.75 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1847  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.27 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1671  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.27 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  37.5 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.74 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.59 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  50 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.03 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.27 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44431  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.57 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.46 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.46 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.51 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.98 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2019  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.5 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.8 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0700  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.66 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.5 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0689  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.66 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0250879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  38.27 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.27 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.24 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.35 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0203  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.51 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.68 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0663  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.25 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.242744 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0041  export protein FliQ  40.3 
 
 		 82 aa  57  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4195  export protein FliQ  44.93 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.04 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.06 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.06 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.8 
 
 		 89 aa  57  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.51 
 
 		 89 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0155  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.89 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  36.36 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1117  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.8 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0090  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.66 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1027  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.74 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1133  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.13 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.57 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.57 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0216  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.8 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1038  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.13 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  39.44 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.98 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02876  flagellar biosynthesis  32.1 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1337  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.13 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3665  export protein FliQ  32.47 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3055  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.04 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341394  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1932  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.28 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.618513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>