More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2034 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  100 
 
 
89 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  62.92 
 
 
89 aa  122  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.06 
 
 
89 aa  104  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  102  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  99  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.73 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.73 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  89.4  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  87  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.99 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.32 
 
 
89 aa  83.6  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.13 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.96 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.59 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  50.56 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.95 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.48 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.91 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.5 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  45.24 
 
 
89 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.51 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.17 
 
 
89 aa  77  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.48 
 
 
89 aa  77  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.46 
 
 
83 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.98 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  40.45 
 
 
91 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.04 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0576  flagellar biosynthesis protein  49.38 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1027  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.43 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2005  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.53 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.2 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.64 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.77 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.52 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0619  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.98 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.08 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0787  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.44 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000782848  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.5 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2019  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.86 
 
 
89 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1847  flagellar biosynthesis protein FliQ  50.56 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  37.08 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1671  flagellar biosynthesis protein FliQ  50.56 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  34.83 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.37 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.75 
 
 
89 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.25 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0155  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.28 
 
 
88 aa  72  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.25 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.74 
 
 
84 aa  71.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0216  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.71 
 
 
93 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397416  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0203  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.13 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2958  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.32 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  45 
 
 
92 aa  70.1  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.8 
 
 
84 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.96 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.18 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.96 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44431  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.45 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.74 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.05 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.9 
 
 
90 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5152  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.04 
 
 
88 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458719  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2828  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.14 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.224075 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2730  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.24 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.14 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2605  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.14 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459471  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0280  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.17 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.72 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.16 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.05 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3880  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.21 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1332  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.05 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.498706  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.64 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.77 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5535  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.77 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.8 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0561  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.95 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68477  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.84 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1551  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.44 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1611  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.86 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.51 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.8 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.75 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4384  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.91 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2403  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2138  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.24 
 
 
89 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2196  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.24 
 
 
89 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15457  normal  0.786149 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2303  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1139  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.24 
 
 
89 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00184506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>