More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2395 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  100 
 
 
89 aa  174  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.73 
 
 
89 aa  89.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.31 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.86 
 
 
89 aa  87  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.44 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.59 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.32 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0738  type III secretion protein, HrpO family  48.24 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.18 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.18 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.05 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0737  type III secretion protein, HrpO family  49.38 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0357891  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.32 
 
 
89 aa  80.1  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0787  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.56 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000782848  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  45.45 
 
 
92 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.18 
 
 
89 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.18 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  42.7 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  77  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  47.73 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.74 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.23 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1332  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.73 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.498706  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.45 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  43.02 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.98 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.65 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2005  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.08 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207342  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.33 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  45 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.57 
 
 
89 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.46 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.74 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  40.45 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.48 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.86 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.65 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.65 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.38 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.38 
 
 
88 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  39.24 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.23 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2216  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.886542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.83 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  36.36 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.16 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.31 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.5 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.77 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.05 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.77 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2196  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.45 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15457  normal  0.786149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1262  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.45 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1618  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1165  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.68 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2138  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.45 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0067  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.45 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.78 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1139  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.45 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00184506  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2918  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.198068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1880  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.32 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1135  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.31 
 
 
87 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0619  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.53 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.05 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1751  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.62 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2303  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.05 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2403  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.05 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2586  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.18 
 
 
89 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2730  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.7 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0216  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397416  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  47.89 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0203  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.53 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.23 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.2 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0280  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.02 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.05 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.05 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2958  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.91 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0155  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.23 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1513  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.26 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.48 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1551  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.91 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0741  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.18 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.153743  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.77 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02876  flagellar biosynthesis  34.09 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>