258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0852 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  100 
 
 		 94 aa  184  3e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  46.99 
 
 		 86 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3009  HrpO family type III secretion protein  49.4 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.24 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  43.06 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5927  HrpO family type III secretion protein  41.56 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.67 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.79 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.75 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5862  HrpO family type III secretion protein  40.26 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003361  type III secretion protein YscS  41.1 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  42.86 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.44 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.44 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5645  HrpO family type III secretion protein  38.96 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0584455 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.93 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.71 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.71 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.15 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.19 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.12 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2131  export protein FliQ  41.67 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.74 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.94 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.89 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.42 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.04 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3079  secretory protein EpaQ  42.03 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3042  EpaQ  42.03 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.230102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3199  hypothetical protein  42.03 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3094  hypothetical protein  42.03 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3011  EpaQ  42.03 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.11 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.25 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0737  type III secretion protein, HrpO family  42.5 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0357891  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0738  type III secretion protein, HrpO family  41.25 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4229  HrpO family type III secretion protein  34.94 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.619618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4752  HrpO family type III secretion protein  34.94 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.61 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3740  HrpO family type III secretion protein  34.94 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.721629  hitchhiker  0.00976692 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0431  type III secretion inner membrane protein SctS  38.16 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0732733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.54 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2001  HrpO family type III secretion protein  38.16 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1909  HrpO family type III secretion protein  38.16 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.53 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0755  type III secretion inner membrane protein SctS  36.36 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313382  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5429  HrpO family type III secretion protein  33.73 
 
 		 92 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751272  normal  0.141963 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3511  Type III secretion protein HrpO  33.73 
 
 		 92 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.124338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42630  putative translocation protein in type III secretion  41.67 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4855  HrpO family type III secretion protein  33.73 
 
 		 92 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.67 
 
 		 89 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2213  type III secretion protein, HrpO family  33.33 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.93 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0847  HrpO family type III secretion protein  38.03 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.693953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.89 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3183  type III secretion apparatus protein EpaQ  38.03 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4140  type III secretion apparatus protein EpaQ  38.03 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912343 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3017  type III secretion apparatus protein EpaQ  38.03 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000282862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  32.91 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0188  Spa9  39.13 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.11 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.28 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1394  type III secretion protein HrcS  38.46 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.54 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1751  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.18 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.89 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.65 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  36 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.19 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.71 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1535  type III secretion system protein BsaX  37.18 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164439  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1627  type III secretion inner membrane protein SctS  33.77 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0576  type III secretion system protein BsaX  37.18 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0675  type III secretion inner membrane protein SctS  33.77 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0793494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2194  HrpO family type III secretion protein  33.77 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.89 
 
 		 89 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0837  type III secretion system protein BsaX  37.18 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.392473  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0638  type III secretion inner membrane protein SctS  33.77 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.43 
 
 		 89 aa  52.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0749  type III secretion system protein BsaX  37.18 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.685572  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1958  type III secretion inner membrane protein SctS  33.77 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2069  type III secretion system protein BsaX  37.18 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2078  HrpO family type III secretion protein  37.18 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.624451  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2166  HrpO family type III secretion protein  37.18 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.770175  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2277  HrpO family type III secretion protein  33.77 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1513  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.36 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2019  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.67 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.11 
 
 		 89 aa  52  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.28 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0047  HrpO family type III secretion protein  33.8 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.54 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.62 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2171  flagellar hook-associated protein  37.04 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>