92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5927 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5927  HrpO family type III secretion protein  100 
 
 		 87 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5645  HrpO family type III secretion protein  58.62 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0584455 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5862  HrpO family type III secretion protein  58.62 
 
 		 87 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0755  type III secretion inner membrane protein SctS  60.92 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313382  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0638  type III secretion inner membrane protein SctS  58.62 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2194  HrpO family type III secretion protein  58.62 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2277  HrpO family type III secretion protein  58.62 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1958  type III secretion inner membrane protein SctS  58.62 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0675  type III secretion inner membrane protein SctS  58.62 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0793494  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1627  type III secretion inner membrane protein SctS  58.62 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0431  type III secretion inner membrane protein SctS  51.16 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0732733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1909  HrpO family type III secretion protein  51.16 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2001  HrpO family type III secretion protein  51.16 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0448  HrpO family type III secretion protein  53.01 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100595 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003361  type III secretion protein YscS  46.75 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  46.75 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  46.97 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3009  HrpO family type III secretion protein  48.48 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  41.56 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0859  Hrp conserved HRCS transmembrane protein  53.25 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0274249  hitchhiker  0.00877367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4229  HrpO family type III secretion protein  43.9 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.619618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4752  HrpO family type III secretion protein  43.9 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  41.56 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3740  HrpO family type III secretion protein  43.9 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.721629  hitchhiker  0.00976692 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5429  HrpO family type III secretion protein  43.9 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751272  normal  0.141963 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3511  Type III secretion protein HrpO  43.9 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.124338  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4855  HrpO family type III secretion protein  43.9 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03407  HrcS  46.27 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.37 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5211  type III secretion protein, HrpO family  35.29 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  34.94 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42630  putative translocation protein in type III secretion  41.56 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355777  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.15 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.25 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1394  type III secretion protein HrcS  37.14 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.76 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  27.71 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0847  HrpO family type III secretion protein  33.33 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.693953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4140  type III secretion apparatus protein EpaQ  33.33 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912343 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3183  type III secretion apparatus protein EpaQ  33.33 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3017  type III secretion apparatus protein EpaQ  33.33 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000282862  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  27.71 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2213  type III secretion protein, HrpO family  32.43 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.29 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3901  HrpO family type III secretion protein  46.67 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3813  HrpO family type III secretion protein  46.67 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3928  HrpO family type III secretion protein  46.67 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  28.95 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.93 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.76 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1535  type III secretion system protein BsaX  41.18 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164439  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0749  type III secretion system protein BsaX  41.18 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.685572  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0837  type III secretion system protein BsaX  41.18 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.392473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2069  type III secretion system protein BsaX  41.18 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19982  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0576  type III secretion system protein BsaX  41.18 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2078  HrpO family type III secretion protein  41.18 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.624451  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.1 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2166  HrpO family type III secretion protein  41.18 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.770175  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.27 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.75 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.03 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  34.85 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  24.69 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.53 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0047  HrpO family type III secretion protein  34.29 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3094  hypothetical protein  32.93 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3079  secretory protein EpaQ  32.93 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3042  EpaQ  32.93 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.230102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3011  EpaQ  32.93 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3199  hypothetical protein  32.93 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.87 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0188  Spa9  35.21 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0111  export protein FliQ  35.94 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131066  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  26.83 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1884  type III secretion protein, HrpO family  34.72 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  36 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  29.11 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.33 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.03 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2828  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.35 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.224075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2605  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.35 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459471  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.63 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2279  HrpO family type III secretion protein  37.66 
 
 		 89 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0217688  normal  0.613678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1975  HrpO family type III secretion protein  37.66 
 
 		 89 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.35 
 
 		 88 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  27.59 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0625  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.03 
 
 		 89 aa  40.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  27.38 
 
 		 89 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  27.63 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0737  type III secretion protein, HrpO family  39.19 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0357891  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1751  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.79 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>