201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2414 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  100 
 
 		 86 aa  166  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3009  HrpO family type III secretion protein  89.53 
 
 		 86 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  61.43 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  46.99 
 
 		 94 aa  88.2  4e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  61.43 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003361  type III secretion protein YscS  60 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3079  secretory protein EpaQ  56.52 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3199  hypothetical protein  56.52 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3011  EpaQ  56.52 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3042  EpaQ  56.52 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.230102 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3094  hypothetical protein  56.52 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227006 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0188  Spa9  56.52 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0847  HrpO family type III secretion protein  53.62 
 
 		 86 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.693953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3183  type III secretion apparatus protein EpaQ  53.62 
 
 		 86 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3017  type III secretion apparatus protein EpaQ  53.62 
 
 		 86 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000282862  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4140  type III secretion apparatus protein EpaQ  53.62 
 
 		 86 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2213  type III secretion protein, HrpO family  52.86 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5645  HrpO family type III secretion protein  47.83 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0584455 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5862  HrpO family type III secretion protein  47.14 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0047  HrpO family type III secretion protein  46.25 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1394  type III secretion protein HrcS  43.75 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42630  putative translocation protein in type III secretion  56.94 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355777  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1627  type III secretion inner membrane protein SctS  44.93 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0675  type III secretion inner membrane protein SctS  44.93 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0793494  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0755  type III secretion inner membrane protein SctS  44.29 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1958  type III secretion inner membrane protein SctS  44.93 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2277  HrpO family type III secretion protein  44.93 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2194  HrpO family type III secretion protein  44.93 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0638  type III secretion inner membrane protein SctS  44.93 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5927  HrpO family type III secretion protein  46.97 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.11 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1535  type III secretion system protein BsaX  52 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164439  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0576  type III secretion system protein BsaX  52 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179299  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0837  type III secretion system protein BsaX  52 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.392473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2069  type III secretion system protein BsaX  52 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2166  HrpO family type III secretion protein  52 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.770175  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2078  HrpO family type III secretion protein  52 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.624451  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0749  type III secretion system protein BsaX  52 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.685572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1884  type III secretion protein, HrpO family  57.58 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4229  HrpO family type III secretion protein  39.06 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.619618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4752  HrpO family type III secretion protein  39.06 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0431  type III secretion inner membrane protein SctS  42.25 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0732733  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3740  HrpO family type III secretion protein  39.06 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.721629  hitchhiker  0.00976692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3511  Type III secretion protein HrpO  39.06 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.124338  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4855  HrpO family type III secretion protein  39.06 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5429  HrpO family type III secretion protein  39.06 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751272  normal  0.141963 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2001  HrpO family type III secretion protein  42.25 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1909  HrpO family type III secretion protein  42.25 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5211  type III secretion protein, HrpO family  41.43 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0273  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.98 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.941775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3901  HrpO family type III secretion protein  50 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.67 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3928  HrpO family type III secretion protein  50 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1207  type III secretion protein HrcS  45 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.427882 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.14 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.98 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.14 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3813  HrpO family type III secretion protein  50 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.8 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0448  HrpO family type III secretion protein  36.51 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0111  export protein FliQ  43.66 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131066  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0048  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.57 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1751  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.98 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.57 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2131  export protein FliQ  44.29 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  44.44 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0738  type III secretion protein, HrpO family  41.25 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.8 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.8 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.67 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.8 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.89 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.28 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0737  type III secretion protein, HrpO family  41.25 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0357891  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0282  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.04 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.89 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  35.29 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.07 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.91 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.44 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.71 
 
 		 89 aa  52.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0787  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.98 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000782848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.43 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0859  Hrp conserved HRCS transmembrane protein  43.1 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0274249  hitchhiker  0.00877367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0689  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.11 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0250879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0700  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.11 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.86 
 
 		 89 aa  52  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.63 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2279  HrpO family type III secretion protein  52.08 
 
 		 89 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0217688  normal  0.613678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1975  HrpO family type III secretion protein  52.08 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.94 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0625  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.48 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1135  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.74 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0663  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.11 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.242744 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.43 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.46 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>